Projektet syftar till att harmonisera och effektivisera produktionen av mikrobiellt genomdata vid THL och nationellt inom de klinisk‑mikrobiologiska laboratorierna, samt att integrera produktion och analys av genomdata i den nationella övervakningen av infektionssjukdomar.
Projektet bygger vidare på ett tidigare EU‑finansierat projekt som fokuserade på att förbättra infrastrukturen för produktion av genomdata.
Mål
- Rutinmässigt utnyttjande av den anskaffade utrustningen
- Effektivisering av sekvensering för utvalda mikrober (SARS‑CoV‑2, influensa, RSV, bakteriella infektioner)
- Utveckling av laboratoriebaserade metoder för övervakning av luftvägsvirus
- Upprätthållande och utveckling av det nationella bioinformatiknätverket för mikrobiologi
- Insamling av nationella helgenomsekvensdata (WGS)
- WGS‑stöd till klinisk‑mikrobiologiska laboratorier
- Utveckling av ett övervakningssystem för luftvägsvirus
- Pilotering av integrering av sekvensdata i det nationella övervakningssystemet
Genomförande
Projektet genomförs i fyra arbetspaket:
- TP1. Administration och koordinering
- TP2. Laboratoriemetoder och processer
- TP3. Bioinformatik inom folkhälsomikrobiologi i Finland
- TP4. Övervakningssystem
Finansiering
European Health and Digital Executive Agency (HaDEA)
Samarbetspartner
FIMLAB (Tammerfors), HUS Diagnostikcentrum (Helsingfors), ISLAB (Kuopio), Tyks Laboratorier (Åbo), Nordlab (Uleåborg)
Kontaktinformation
Uppdaterad: