Beskrivning av tjänsten
Som avgiftsbelagd tjänst erbjuds sekvensering för följande bakterier:
- Epidemiutredningar av bakterier som producerar ESBL/AmpC‑bredspektrum‑ eller AmpC‑klassens betalaktamasenzymer
- CPE‑miljöisolat i samband med epidemiutredningar
- MRSA – meticillinresistent Staphylococcus aureus
- VRE – vankomycinresistent enterokock
- Streptococcus pyogenes
I tjänsten ingår DNA‑isolering av bakteriestammen, den laboratoriemässiga delen av sekvenseringen samt analys av sekvensen.
För vem tjänsten är avsedd
Tjänsten är avsedd för laboratorier inom klinisk mikrobiologi samt för hälso- och sjukvårdens verksamhetsenheter inom välfärdsområdena (t.ex. hälsocentraler och sjukhus).
Det här kan du förvänta dig av oss
Resultaten rapporteras i ett testsvar så snart de är färdiga.
Avgifter
DNA‑isolering av bakteriestammen och den laboratoriemässiga delen av sekvenseringen är avgiftsbelagda. Analysen av sekvensen utförs utan kostnad.
Helgenomsekvensering, Whole Genome Sequencing (WGS)
217,26 € (moms 0 %) / bakteriestam
Fakturan skickas till det laboratorium inom klinisk mikrobiologi som har sänt in bakteriestammen.
Så går du tillväga
Välfärdsområde, epidemiutredningsgrupp eller kliniker
- Kontakta THL:s ansvarsperson för att bedöma behovet av helgenomsekvensering (WGS) och för att förmedla bakgrundsinformation.
- Om sekvensering är motiverad, be laboratoriet inom klinisk mikrobiologi att skicka stammen för sekvensering och att meddela THL orsaken till sekvenseringsbegäran.
Laboratorium inom mikrobiologi
- Kontakta THL:s sakkunniga före provsändningen.
- Anteckna följande på provremissen:
- Kommunförbundets forskningskod – BaktWGS
- Orsaken till sekvenseringen
- Kontaktuppgifter till den instans som begärt sekvenseringen (namn, telefonnummer och e‑postadress)
Kontakta oss
MRSA och VRE
Laura Lindholm, specialforskare
Tel. 029 524 7493
Santeri Soininen, laboratorieforskare
Tel. 029 524 8049
CPE och ESBL
Kati Räisänen, specialsakkunnig
Tel. 029 524 7094
Santeri Soininen, laboratorieforskare
Tel. 029 524 8049
Streptococcus pyogenes
Hanne‑Leena Hyyryläinen, specialforskare
Tel. 029 524 6123
WGS‑laboratoriemetoder
Anni Vainio, specialforskare
Tel. 029 524 8171
Fakturering
Minna Sassi
Tel. 029 524 7365
E‑postadresserna är i formatet fö[email protected].
Uppdaterad: