Sjukdomsklass: annan anmälningspliktig mikrobiologisk fyndighet
Stamkollektion: ingår inte i stamkollektionen för registret över smittsamma sjukdomar
Stammar som ska skickas
Endast stammar från allvarliga infektioner och epidemimisstankar.
Kontakta alltid THL:s laboratorium/expert innan provet skickas.
Skicka provet som renodling i transporttub avsedd för anaerober eller på odlingsskål i anaerobpåse.
Laboratorieundersökningar
- Artverifiering (helgenomsekvensering, WGS)
- Toxingener (tcdA, tcdB och cdtB) (helgenomsekvensering, WGS)
- Genotyp (helgenomsekvensering, WGS)
- Stamjämförelse (helgenomsekvensering, WGS)
Kontaktuppgifter
Silja Mentula, specialsakkunnig
Tfn 029 524 8161
Anja Paananen, laboratorieforskare
Tfn 029 524 8186
Marja Veckström, forskningsanalytiker
Tfn 029 524 7144
Sjukdomsklass: andra smittsamma sjukdomar
Stamkollektion: ingår inte i stamkollektionen för registret över smittsamma sjukdomar
Stammar som ska skickas
Endast stammar som hänför sig till epidemimisstankar.
Kontakta THL:s laboratorium/expert innan provet skickas.
Skicka provet som renodling i transporttub avsedd för anaerober eller på odlingsskål.
Laboratorieundersökningar
- Artverifiering (helgenomsekvensering, WGS)
- Cpe-toxingener, toxinprofil (helgenomsekvensering, WGS)
Kontaktuppgifter
Silja Mentula, specialsakkunnig
Tfn 029 524 8161
Anja Paananen, laboratorieforskare
Tfn 029 524 8186
Marja Veckström, forskningsanalytiker
Tfn 029 524 7144
Campylobacter jejuni och Campylobacter coli
Sjukdomsklass: andra smittsamma sjukdomar
Stamkollektion: ingår inte i stamkollektionen för registret över smittsamma sjukdomar
Stammar som ska skickas
Endast stammar som hänför sig till epidemimisstankar.
Kontakta THL:s laboratorium/expert innan provet skickas.
Skicka provet som renodling i transporttub eller på odlingsskål.
Laboratorieundersökningar
- Artverifiering vid behov (biokemiska tester eller helgenomsekvensering, WGS)
- Stamjämförelse vid epidemisituationer (helgenomsekvensering, WGS)
Kontaktuppgifter
Ulla-Maija Nakari, specialsakkunnig
Tfn 029 524 7373
Anja Paananen, laboratorieforskare
Tfn 029 524 8186
Yersinia enterocolitica och Yersinia pseudotuberculosis
Sjukdomsklass: andra smittsamma sjukdomar
Stamkollektion: ingår inte i stamkollektionen för registret över smittsamma sjukdomar
Stammar som ska skickas
Endast stammar som hänför sig till epidemimisstankar eller allvarliga infektioner. Kontakta THL:s laboratorium/expert innan provet skickas. Skicka provet som renodling i transporttub eller på odlingsskål.
Laboratorieundersökningar
- Artverifiering (helgenomsekvensering, WGS)
- Serotypning (helgenomsekvensering, WGS)
- Stamjämförelse (helgenomsekvensering, WGS)
- MLST (helgenomsekvensering, WGS)
Kontaktuppgifter
Saara Salmenlinna, ledande expert
Tfn 029 524 7944
Cryptosporidium‑protozoer
Prover som ska skickas
Endast prover som hänför sig till misstänkta epidemier tas emot.
Kontakta THL:s laboratorium eller sakkunnig innan provet skickas.
Skicka ett DNA‑prov eller ett avföringsprov (i eNAT‑lösning, formalin eller som sådant) till THL:s laboratorium.
Laboratorieundersökningar
- Artbestämning av Cryptosporidium‑parasiten med 18S rRNA‑sekvensering eller, vid brådskande fall, med real‑time PCR
- Mer detaljerad typning av parasiterna med Gp60‑metoden
Kontaktuppgifter
Anni Vainio, specialforskare
Tel. 029 524 8171
Anja Paananen, laboratorieforskare
Tel. 029 524 8186