THL förvarar arkivmaterial från sina föregångande myndigheter.
Folkhälsoinstitutet (1911–31.12.2008)
Folkhälsoinstitutets (KTL) historia började år 1911 som en statlig tillfällig serumlaboratorieenhet under Medicinalstyrelsen. KTL grundades 1982 och dess verksamhet upphörde 31.12.2008. THL förvarar följande arkiv:
Statliga tillfälliga serumlaboratoriet (1911–1914)
Statliga serumlaboratoriet (1915–1946)
Statliga serumverket (1947–1969)
Folkhälsolaboratoriet (1970–1981)
Folkhälsoinstitutet (1982–2008)
Stakes (1.12.1992–31.12.2008)
Forsknings- och utvecklingscentralen för social- och hälsovården (Stakes) inledde sin verksamhet 1.12.1992 och upphörde 31.12.2008. Dess handlingar är arkiverade för hela verksamhetsperioden.
Social- och hälsovårdsstyrelsen (1.3.1991–1.12.1992)
Social- och hälsovårdsstyrelsen (STH) grundades 1.3.1991 i stället för Medicinalstyrelsen och Socialstyrelsen. Organisationen reformerades redan 1.12.1992, varvid namnet ändrades till Stakes.
En del av uppgifterna överfördes till social- och hälsovårdsministeriet, en del till Rättsskyddscentralen för hälsovården (från 1.1.2009 Valvira), och en del till Läkemedelsverket 1993.
THL förvarar STH:s handlingar för hela dess verksamhetsperiod.
Medicinalstyrelsen (1811–1991)
Medicinalstyrelsen inledde sin verksamhet 1811 och upphörde i förvaltningsreformen 1991.
THL förvarar handlingar från 1950-talet fram till nedläggningen. De flesta handlingarna hos THL omfattas av tidsbegränsad förvaring. Handlingar som ska bevaras permanent ska i första hand begäras från Riksarkivet.
Socialstyrelsen och Socialministeriet
Socialstyrelsen grundades 1917 och lades ned 1923. Efter nedläggningen sköttes dess uppgifter av Socialministeriet (1917–1967). År 1968 grundades en ny Socialstyrelse, som lades ned 1991.
Socialstyrelsens och Socialministeriets arkivmaterial har överförts till Riksarkivet. Handlingar begärs därifrån.