Palvelun kuvaus
Maksupalveluna tarjotaan sekvensointia seuraaville bakteereille:
- ESBL/AmpC laajakirjoisia tai AmpC-luokan beetalaktamaasientsyymejä tuottavien bakteerien epidemiaselvitykset
- CPE-ympäristökannat epidemiaselvityksiin liittyen
- MRSA Metisilliiniresistentti Staphylococcus aureus
- VRE Vankomysiiniresistentti enterokokki
- Streptococcus pyogenes
Palveluun kuuluu bakteerikannan DNA-eristys ja sekvensoinnin laboratoriotyön osuus sekä sekvenssin analysointi.
Kenelle tarjoamme palvelua
Palvelu on tarkoitettu kliinisen mikrobiologian laboratorioille sekä hyvinvointialueiden terveydenhuollon toimintayksiköille (esim. terveyskeskuksille ja sairaaloille).
Tätä voit odottaa meiltä
Tulokset vastataan testausselosteella niiden valmistuttua.
Maksullisuus
Bakteerikannan DNA-eristys ja sekvensoinnin laboratoriotyön osuus on maksullista. Sekvenssin analyysi tehdään maksutta.
Kokogenomisekvensointi, Whole Genome Sequencing (WGS) 217,26 € (alv 0 %) / bakteerikanta.
Lasku lähetetään kliinisen mikrobiologian laboratoriolle, josta bakteerikanta on lähetetty.
Näin asioit ja otat yhteyttä
Hyvinvointialue, epidemiaselvitysryhmä tai kliinikko
- Ole yhteydessä THL:n vastuuhenkilöön kokogeminsekvensoinnin (WGS) tarpeellisuuden arvioimiseksi ja taustatietojen välittämiseksi
- Jos sekvensointi on tarpeellinen, pyydä kliinisen mikrobiologian laboratoriota lähettämään kanta sekvensointia varten ja välittämään THL:lle tieto sekvensoinnin syystä
Mikrobiologian laboratorio
- Ota yhteyttä THL:n asiantuntijaan ennen näytteen lähettämistä.
- Kirjaa näytelähetteeseen:
- Kuntaliiton tutkimuskoodi - BaktWGS
- sekvensoinnin syy
- Sekvensointia pyytäneen tahon yhteystieto (nimi, puhelinnumero ja sähköposti)
Vastuuhenkilöt
MRSA ja VRE
Laura Lindholm, erikoistutkija
Puh. 029 524 7493
Santeri Soininen, laboratoriotutkija
Puh. 029 524 8049
CPE ja ESBL
Kati Räisänen, erityisasiantuntija
Puh. 029 524 7094
Santeri Soininen, laboratoriotutkija
Puh. 029 524 8049
Streptococcus pyogenes
Hanne-Leena Hyyryläinen, erikoistutkija
Puh. 029 524 6123
WGS-laboratoriomenetelmät
Anni Vainio, erikoistutkija
Puh. 029 524 8171
Laskutus
Minna Sassi
Puh. 029 524 7365
Sähköpostiosoitteet ovat muotoa [email protected]
Päivitetty: