Palvelun kuvaus
Osa resistenteistä bakteereista lähetetään Terveyden ja hyvinvoinninlaitoksen (THL) mikrobiologian laboratorioihin jatkotutkimuksiin. THL:lla tehtävät tutkimukset perustuvat genotyyppisiin menetelmiin kuten kokogenomisekvensointiin, jota käytetään seurannassa sekä epidemiaselvitysten tukena.
Kliinisen mikrobiologian laboratoriot sekä hyvinvointialueiden terveydenhuollon toimintayksiköt ilmoittavat THL:n ylläpitämään tartuntatautirekisteriin seuraavat resistentit mikrobilöydökset:
- MRSA
- VRE eli vankomysiinille resistentti enterokokki
- ESBL-Escherichia coli eli mahdollinen 3. polven kefalosporiineille herkkyydeltään alentunut ja resistentti Escherichia coli.
- ESBL-Klebsiella pneumoniae eli mahdollinen 3. polven kefalosporiineille herkkyydeltään alentunut ja resistentti Klebsiella pneumoniae.
- CPE eli mahdollisesti karbapeneemiherkkyydeltään alentuneet ja resistentit enterobakterales-bakteerit (E. coli, K. pneumoniae ja Enterobacter cloacae) ja karbapenemaasia tuottavat enterobakterales-bakteerit (CPE).
Ilmoituksilla kerätään tietoa infektioiden lisäksi kantajuudesta. Erikseen tilastoidaan vielä vakavat yleisinfektiot, joissa bakteeri kasvaa veressä tai aivo-selkäydinnesteessä.
Tärkeää tietoa palvelusta
Terveyden ja hyvinvoinnin laitoksen mikrobiologian laboratoriot tutkivat ja seuraavat keskitetysti infektiotautien esiintyvyyttä, sekä infektiotauteja aiheuttavien bakteerien sekä virusten tyyppijakaumaa ja ominaisuuksia.
Seurannan tavoitteena on epidemioiden varhainen toteaminen, tilannekuvan ylläpito sekä torjuntaohjelmien suunnittelu ja vaikuttavuuden seuranta sekä rokotusohjelmien ajantasaisuuden tukeminen.
Jatkuvasti seurattavat mikrobit ovat yleisvaarallisia tai valvottavia tartuntatauteja aiheuttavia. THL tutkii tarkemmin myös eräitä muita tartuntatauteja aiheuttavia mikrobeja, joko niiden aiheuttaman tautitaakan, epidemiavaaran vuoksi sekä rokotevastaavuuden arvioinnin vuoksi.
Seuranta perustuu tartuntatautilakiin (1227/2016) ja valtioneuvoston asetukseen tartuntataudeista (146/2017), ja edellyttää mikrobikantojen tai tarvittaessa näytteiden lähettämistä Terveyden ja hyvinvoinnin laitokselle.
Kenelle tarjoamme palvelua
Palvelu on tarkoitettu kliinisen mikrobiologian laboratorioille sekä hyvinvointialueiden terveydenhuollon toimintayksiköille (esim. terveyskeskuksille ja sairaaloille).
Tätä voit odottaa meiltä
Tartuntatautirekisterin kantakokoelma- ja seurantanäytteet tutkitaan pääosin maksutta.
Tulokset vastataan testausselosteella niiden valmistuttua.
Maksullisuus
Seuraaville kannoille kokogenomisekvensointi on maksullista:
- ESBL/AmpC laajakirjoisia tai AmpC-luokan beetalaktamaasientsyymejä tuottavien bakteerien epidemiaselvitykset
- CPE-ympäristökannat epidemiaselvityksiin liittyen
- MRSA Metisilliiniresistentti Staphylococcus aureus
- VRE Vankomysiiniresistentti enterokokki
Lisätietoa palvelun tilaamisesta: Bakteerikantojen kokogenominsekvensoinnin (WGS) -maksupalvelu
Näin asioit ja otat yhteyttä
Lähetteenä toimii lähettävän laboratorion tietojärjestelmän tuottama kantakokoelmalähete tai muu vastaava lomake. Lähetteestä tulee ilmetä:
- tutkittavan henkilötiedot: nimi, hetu, sukupuoli
- mikrobilöydöksen nimi, tunnus ja erikseen ilmoitettavat mikrobiologiset ominaisuudet näytteenottopäivä
- näytenumero
- mikrobin toteamistapa, esimerkiksi viljely, nukleiinihaponosoitus, antigeeniosoitus jne.
- näytelaatu
- ilmoittavan ja lähettävän laboratorion nimi ja tunnus
- hoitopaikka: nimi, osasto, kunta
- suolistobakteeri-infektioissa tieto edeltävästä ulkomaanmatkasta (oletettu tartuntamaa)
- resistenteille bakteereille ja tarvittaessa myös muille mikrobeille näytteenoton syy (oireet, seuranta, seulonta, epidemiaepäily, ei tietoa)
- mahdolliset ulkomaanmatkat: tieto sairaalahoidosta ulkomailla, matkustusmaa, jos tiedossa
- mahdolliset laboratorion omat herkkyysmääritystulokset
Näytteen lähetysohjeet
- Pakkaa huolellisesti täytetty lähete ja näyte (kuljetusputkessa tai maljalla) kategoria B:n kelta-mustaraidalliseen laatikkoon.
- Huomioi myös vastaanottajan työturvallisuus: merkitse näytteet selkeästi ja pakkaa eri mikrobilajit omiin suljettaviin pusseihinsa.
Näytteen lähetysosoite
Terveyden ja hyvinvoinnin laitos
Bakteriologia
Tutkimuskeskus Neulanen
PL 95, 70701 Kuopio
Sähköisesti laboratorion tietojärjestelmästä tilattava tutkimus
Organisaatiollanne on mahdollisuus siirtyä sähköiseen lähete-vastausliikenteeseen (HL7). Jos haluatte ottaa yhteyden käyttöön, ota yhteyttä THL:n LIMS-hankkeen projektipäällikköön Heidi Haapojaan [email protected], puh. 029 524 7447.
Tarjoamme seuraavat tutkimukset sähköisesti
| THL tutkimusnumero ja lyhenne | Pitkä nimi | Tutkimuksen kuvaus |
| 6721 -BKanta | Bakteeri kantakokoelmanäyte | Kaikki kantakokoelmaan lähetettävät bakteerikannat ja -näytteet. Myös hiivat, sienet ja alkueläimet. |
| 7926 -BaktWGS | Bakteeri kokogenomisekvensointi | Bakteerikannan kokogenomisekvensointi maksupalveluna |
Päivitetty: