Koronaviruksen jätevesiseuranta: omikronin uusimmat alalinjat yleisimpiä koronavirusmuunnoksia Suomessa
Terveyden ja hyvinvoinnin laitoksen (THL) jätevesiseurannan tulosten mukaan koronaviruksen omikronmuunnoksen BA.4/BA.5-alalinjat ovat nyt yleisimpiä koronavirusmuunnoksia Suomessa. Alalinjoihin BA.4 ja BA.5 viittaavien mutaatioiden suhteellinen osuus yhteensä ohitti BA.2-alalinjan yleisyyden juhannuksen tietämillä seurantapaikkakuntien jätevesissä. Samaan aikaan (viikko 25) uusimmista alalinjoista tuli valtavirus myös koko maan kattavassa varianttisekvensoinnin otosseurannassa, jota tehdään laboratoriovarmistetuille COVID-19-näytteille.
Jätevesiseuranta kartoittaa koronaviruksen perimäaineksen (RNA) kokonaismäärää ja eri koronavirusmuunnosten suhteellisten osuuksia Suomen jätevedessä. RNA-lukumäärä on säilynyt jätevedessä korkealla tasolla, eli tartuntoja on väestössä edelleen paljon. Koska suuri osa tartunnoista todennetaan ainoastaan kotitesteillä, tilanne ei käy ilmi laboratoriovarmistetuista tapauksista.
Kun virukset lisääntyvät, niiden perimään ilmaantuu muutoksia eli mutaatioita. Mutaatiot ovat osa virusten luonnollista evoluutioprosessia. Omikronin BA.4 ja BA.5 -alalinjojen erottaminen toisistaan jätevesiaineistosta ei toistaiseksi ole mahdollista niiden perimäaineksen samankaltaisuuden takia.
Ensimmäiset havainnot uusimmista alalinjoista toukokuussa
Omikron BA.4/5 -alalinjoja havaittiin Suomen jätevesissä ensimmäistä kertaa 8.–9.5.2022 Kuopion jätevedessä. Toukokuun loppuun mennessä Kyseisiä alalinjoja oli havaittavissa jo kymmenen eri seurantapaikkakunnan jätevedessä. Uusimmat valmistuneet sekvensointitulokset ovat heinäkuun 2022 puolessa välissä kerätyistä jätevesinäytteistä, jolloin nämä uusimmat alalinjat olivat yleisimpiä kaikilla THL:n jätevesiseurannassa mukana olevilla paikkakunnilla.
SARS-CoV-2-virusmuunnosten suhteelliset osuudet Suomen jätevesinäytteissä seurannassa olevien puhdistamojen alueilta yhteensä ajanjaksolla 1.1.– 18.7.2022 sekvensoiduissa jätevesinäytteissä. Haaleampi osa kuvaa keskihajontaa eri puhdistamoiden tuloksista.
Ensimmäiset viitteet omikron BA.2 -alalinjasta Suomen jätevesissä saatiin Kuopion ja Lappeenrannan jätevedenpuhdistamolta 2.–3.1.2022 kerätyistä näytteistä. Kyseinen alalinja oli valtavirus maaliskuun alusta kesäkuun loppupuolelle saakka. 17.–18.7. kerätyissä jätevesinäytteissä BA.2-alalinjaa oli havaittavissa enää Kuopion jätevedessä.
Lue lisää: Koronavirusmuunnokset jätevedessä
Jätevesiseurantaa jatketaan viikoittain, seurantapaikkakuntia vähennetään
Koronaviruksen jätevesiseurannassa jatketaan näytteiden keräämistä viikoittain ja kesän raportointitauon jälkeen tulokset julkaistaan taas kerran viikossa perjantaisin klo 12.
Syyskuussa 2022 seurantaa supistetaan siten, että jatkossa RNA-lukumäärä tutkitaan viikoittain 9 paikkakunnan jätevesinäytteistä. Samalla väestökattavuus laskee kansallisella tasolla 50 prosentista n. 45 prosenttiin.
4.–5.9.2022 näytteenotosta alkaen seurannasta jäävät pois Porin Luotsimäen, Hämeenlinnan Paroisten ja Kouvolan Mäkikylän jätevedenpuhdistamot. Lisäksi näytteenottoja harvennetaan kerran kuukaudessa tapahtuvaksi Lappeenrannan Toikansuon ja Rovaniemen Alakorkalon jätevedenpuhdistamoilla.
Muilla seurannassa mukana olevilla jätevedenpuhdistamoilla seurantaa jatketaan nykyisellä rytmillä syksyllä 2022. Näytteet kerätään 4.9.2022 alkaen viikoittain Espoon, Helsingin, Joensuun, Jyväskylän, Kuopion, Oulun, Tampereen, Turun ja Vaasan jätevedenpuhdistamoilta. Lisäksi Rovaniemeltä, Lappeenrannasta, Pietarsaaresta ja Seinäjoelta kerätään näytteet kerran kuussa.
Näytteissä havaitut koronaviruksen RNA-lukumäärät päivittyvät THL:n verkkosivuille jätevesiseurannan viikkoraporttiin. Seurannassa toteutettavat muutokset näkyvät ensimmäistä kertaa viikkoraportissa perjantaina 9.9.2022. Ne jätevesinäytteet, joissa havaitaan koronaviruksen RNA:ta, lähetetään sekvensoitavaksi koronavirusmuunnosten tunnistamiseksi.
Tällä viikolla (7.8.–8.8.2022) viimeisten viiden mittauskerran trendi koronaviruksen RNA-lukumäärissä jätevesiseurannassa mukana olevilla puhdistamoilla oli tasaisen korkealla tasolla. Viiden viimeisen mittauskerran trendi jatkoi nousuaan Jyväskylässä, mutta nousu oli tasaantunut Kuopiossa ja Tampereella. RNA-määrä oli pysynyt tasaisen korkealla tasolla Espoossa, Rovaniemellä, Turussa ja Vaasassa. Sen sijaan koronavirus-RNA-määrä oli kääntynyt laskuun Hämeenlinnan, Joensuun, Lappeenrannan ja Oulun jätevedessä ja laskeva trendi oli jatkunut Helsingissä ja Kouvolassa.
Jätevesiseurannan tuoma tilannekuva koronaviruksen lukumääristä on testausaktiivisuudesta riippumaton ja tukee muita epidemian mittareita.
Lisätietoja
- Lisätietoja koronavirusmuunnoksista jätevedessä
- Koronaviruksen jätevesiseurannan viikkoraportti
- Muuntuneet koronavirukset
Tarja Pitkänen
johtava asiantuntija
THL
puh. 029 524 6315
[email protected]
Anssi Lipponen
erikoistutkija
THL
puh. 029 524 7962
[email protected]
