Koronavirusmuunnoksia pystytään tunnistamaan nyt myös jätevedestä – ensimmäiset havainnot omikronista joulukuun näytteissä

Julkaisuajankohta 21.1.2022

THL:n jätevesiseuranta laajenee tunnistamaan koronavariantteja jätevesinäytteistä. Koronavirusvarianttien tunnistaminen jätevedestä on mahdollista kehittyneillä sekvensointitekniikoilla, vaikka koronaviruksen perimäaines, virus-RNA, on jätevedessä laimentuneena ja se voi olla vioittunut ympäristötekijöiden vaikutuksesta. THL aloitti menetelmän kehittämisen koronavirusmuunnosten tunnistamiseksi jätevesinäytteistä viime vuoden loppupuolella.

Ensimmäinen varmistunut havainto omikronvariantista jätevedestä Suomessa saatiin Espoon Suomenojan jätevedenpuhdistamolle saapuvasta puhdistamattoman jäteveden näytteestä, joka oli kerätty itsenäisyyspäiväviikolla 6.-7.12.2021.

Myös Helsingin jätevedessä oli havaittavissa viitteitä omikronista, mutta havainto jäi kuitenkin epävarmaksi. Helsingin Viikinmäen jätevedenpuhdistamolta 12.-13.12.2021 kerätystä näytteestä havainto omikronvariantista varmistui.

Omikronia havaittiin lisää seuraavalla viikolla eli 19.-20.12.2021 kerätyistä näytteistä, jolloin muunnosta löytyi HUS-alueella Helsingin Viikinmäen, Pirkanmaalla Tampereen Viinikanlahden, Pohjois-Karjalassa Joensuun Kuhasalon, Satakunnassa Porin Luotsinmäen ja Varsinais-Suomessa Turun Kakolanmäen jätevedenpuhdistamoilta. Omikronhavainto jätevedessä jäi epävarmaksi Pohjois-Savossa Kuopion Lehtoniemen puhdistamolta kerätyssä näytteessä. Aiemmilla viikoilla ja muilla seurantapaikkakunnilla omikronmuunnosta ei ole havaittu.

Lue lisää: Koronavirusmuunnokset jätevedessä

Nyt tehdyt alustavat omikronvariantin jätevesilöydökset ajoittuvat ajankohtaan, jolloin omikronin osuus alkoi lisääntyä alueen väestöllä todetuissa koronavirustartunnoissa ennen joulua. Tartuntarekisterin mukaan Suomessa on todettu 5.12.2021 mennessä kerätyissä testipositiivisissa näytteissä yhteensä 20 sekvensoinnilla varmistettua omikronin aiheuttamaa tartuntaa. Näistä yhdeksän oli Helsingin ja Uudenmaan sairaanhoitopiirissä (HUS) ja 11 muissa sairaanhoitopiireissä.

Vielä marraskuussa kaikki jätevesistä tehdyt havainnot koronavirusmuunnoksista edustivat deltavarianttia. Joulukuussa tutkituissa jätevesissä oli ensin havaittavissa pelkästään deltamuunnosta ja sitten deltamuunnoksen ohella omikronmuunnosta.

THL tiedotti 2.12.2021 ensimmäisestä omikronvariantin aiheuttamasta koronavirustartunnasta, jonka jälkeen muunnoksen aiheuttamia tartuntoja on varmistettu enenevässä määrin. Tällä hetkellä omikronmuunnos on tulossa tai on jo tullut valtavirus valtaosalla alueista.

Tällä hetkellä varianttien tunnistusmenetelmällä saadaan jätevesistä vasta alustavia tuloksia, ja jopa kuukauden mittainen sekvensointiviive hidastaa tulosten valmistumista.

Kaikkia kerättyjä jätevesinäytteitä ei ole vielä analysoitu koronavirusmuunnosten varalta. Seuraavan kerran sekvensoinnin tuloksia saadaan aikaisintaan helmikuussa. Tulokset koskevat tammikuun alun tilannetta eri paikkakunnilla.

Jätevesiseuranta jatkuu viikoittain

Vuodenvaihteen jälkeen koronaviruksen jätevesiseurannassa on kerätty näytteitä jo kolmella viikolla. Viimeisimpien eli 16.–17.1.2022 kerättyjen jätevesinäytteiden perusteella koronaviruksen RNA:n kokonaismäärä jätevesissä nousee edelleen.

Viiden viimeisen mittauskerran perusteella koronaviruksen RNA:n määrän havaittiin jatkaneen nousuaan suurimmalla osalla tutkituista jätevedenpuhdistamoista.

Espoossa, Helsingissä, Hämeenlinnassa, Joensuussa, Kuopiossa ja Vaasassa virus-RNA-kopioiden määrä jätevedessä 1000:ta ihmistä kohden vuorokaudessa on jo toista viikkoa peräkkäin mittaushistorian suurin.

Koronaviruksen RNA-määrän pidemmän aikavälin trendi 14 puhdistamon jätevedessä Suomessa yhteensä on noussut yhdenmukaisesti todettujen COVID-19-tapausten määrän lisääntymisen kanssa jo usean viikon ajan.

SARS-CoV-2-viruksen RNA-kopioiden määrä jätevesinäytteissä ja todetut COVID-10-tapaukset 14 puhdistamon alueella yhteensä.

Jätevesiseurannan tuoma tilannekuva koronaviruksen lukumääristä on testausaktiivisuudesta riippumaton ja tukee muita epidemian mittareita.

Koronaviruksen RNA-lukumäärä tutkitaan viikoittain 13 paikkakunnan jätevesinäytteistä: Espoon, Helsingin, Hämeenlinnan, Joensuun, Jyväskylän, Kouvolan, Kuopion, Lappeenrannan, Oulun, Porin, Tampereen, Turun ja Vaasan jätevedenpuhdistamoilta. Lisäksi Rovaniemeltä kerätään näyte kahden viikon välein.

Näytteissä havaitut koronaviruksen RNA-lukumäärät päivittyvät THL:n verkkosivuille jätevesiseurannan viikkoraporttiin kerran viikossa perjantaisin klo 12. Ne jätevesinäytteet, joissa havaitaan koronaviruksen RNA:ta, lähetetään sekvensoitavaksi koronavirusmuunnosten varalta.

Lisätietoja

Tarja Pitkänen
johtava asiantuntija
THL
puh. 029 524 6315
[email protected]

Anssi Lipponen 
erikoistutkija
THL
puh. 029 524 7962
[email protected]

Uutista päivitetty 26.1.2021 klo 8.25: vuosilukuja päivitetty.
Infektiotaudit ja rokotukset Pääsivusto Ympäristöterveys korona - thlfi koronavirus - thlfi vesi - thlfi