Strengthening Environmental Surveillance to Advance Public Health Action (ODIN)
Hankkeen tavoitteena on kehittää genomiikkaa hyödyntävä ympäristöseurantajärjestelmä vesivälitteisille taudinaiheuttajamikrobeille Saharan eteläpuolisissa maissa Afrikassa, ja vahvistaa maiden genomiepidemiologian ja bioinformatiikan kapasiteettia.
Tavoitteet
ODIN-projektin tavoitteena on:
- Kehittää ympäristöseurantaan ja genomiikkaan pohjautuva järjestelmä, joka toimii esimerkiksi vesivälitteisten taudinaiheuttajien ja mikrobilääkeresistenssin ennakkovaroitusjärjestelmänä epidemiatilanteissa.
- Vahvistaa genomiikan ja bioinformatiikan osaamisen kapasiteettia Saharan eteläpuolisissa maissa Afrikassa.
- Vahvistaa kansainvälistä monitieteellistä tutkimusta ja yhteistyötä.
- Viestiä ja tuottaa materiaalia sanitaatiosta ja hygieniasta lisäten paikallisen yhteisön tietoisuutta vesivälitteisistä infektiosairauksista ja siten vähentää sairastavuutta (UN SDG6).
Toteutus
ODIN-projekti sisältää seitsemän työpakettia:
- Projektinhallinta, koordinointi ja johtaminen (koordinaattorina Lundin yliopisto, Ruotsi)
- Ympäristönäytteiden tutkimiseen ja syväsekvensointiin perustuvien infektiotautien seurantajärjestelmien perustaminen Tansaniaan, Kongon demokraattiseen tasavaltaan ja Burkina Fasoon (vastuutahona THL)
- Liikkuvan laboratorion ja analyysimenetelmien kehittäminen vesivälitteisten taudinaiheuttajien seurantaan kohdemaissa Afrikassa
- Metagenomiikan ja bioinformatiikan analyysiprosessien kehittäminen
- Taudinaiheuttajien genomiikan integraatio kansanterveyden seurantajärjestelmiin Tansanissa, Kongon demokraattisessa tasavallassa ja Burkina Fasossa
- Saharan etelänpuolisten Afrikan maiden genomiseurannan kapasiteetin ja tiedonkulun vahvistaminen, sekä genomiikan ja bioinformatiikan koulutuksien järjestäminen
- Tuloksista viestiminen
Yhteistyökumppanit
- Lundin yliopisto (LU), Ruotsi (koordinaattori)
- National Institute for Medical Research (NIMR), Tansania
- Centre National de la Recherche Technologique et Scientifique (CNRST/IRSS-DRCO), Burkina Faso
- University of Kinshasa (UNIKIN), Kongon demokraattinen tasavalta
- Flanders Institute for Biotechnology (VIB), Belgia
- Ghentin yliopisto (UGENT), Belgia
- Norwegian Research Centre (NORCE), Norja
- The Global Health Network (TGHN), University of Oxford, Iso-Britannia
Rahoitus
Euroopan komissio (Horizon Europe)
Global Health EDCTP3
Yhteystiedot
Tarja Pitkänen
johtava asiantuntija
puh. 029 524 6315
sähköposti: [email protected]