Strengthening Environmental Surveillance to Advance Public Health Action (ODIN)

Hankkeen tavoitteena on kehittää genomiikkaa hyödyntävä ympäristöseurantajärjestelmä vesivälitteisille taudinaiheuttajamikrobeille Saharan eteläpuolisissa maissa Afrikassa, ja vahvistaa maiden genomiepidemiologian ja bioinformatiikan kapasiteettia.

Tavoitteet

ODIN-projektin tavoitteena on:

Kehittää ympäristöseurantaan ja genomiikkaan pohjautuva järjestelmä, joka toimii esimerkiksi vesivälitteisten taudinaiheuttajien ja mikrobilääkeresistenssin ennakkovaroitusjärjestelmänä epidemiatilanteissa.
Vahvistaa genomiikan ja bioinformatiikan osaamisen kapasiteettia Saharan eteläpuolisissa maissa Afrikassa.
Vahvistaa kansainvälistä monitieteellistä tutkimusta ja yhteistyötä.
Viestiä ja tuottaa materiaalia sanitaatiosta ja hygieniasta lisäten paikallisen yhteisön tietoisuutta vesivälitteisistä infektiosairauksista ja siten vähentää sairastavuutta (UN SDG6).

Toteutus

ODIN-projekti sisältää seitsemän työpakettia:

Projektinhallinta, koordinointi ja johtaminen (koordinaattorina Lundin yliopisto, Ruotsi)
Ympäristönäytteiden tutkimiseen ja syväsekvensointiin perustuvien infektiotautien seurantajärjestelmien perustaminen Tansaniaan, Kongon demokraattiseen tasavaltaan ja Burkina Fasoon (vastuutahona THL)
Liikkuvan laboratorion ja analyysimenetelmien kehittäminen vesivälitteisten taudinaiheuttajien seurantaan kohdemaissa Afrikassa
Metagenomiikan ja bioinformatiikan analyysiprosessien kehittäminen
Taudinaiheuttajien genomiikan integraatio kansanterveyden seurantajärjestelmiin Tansanissa, Kongon demokraattisessa tasavallassa ja Burkina Fasossa
Saharan etelänpuolisten Afrikan maiden genomiseurannan kapasiteetin ja tiedonkulun vahvistaminen, sekä genomiikan ja bioinformatiikan koulutuksien järjestäminen
Tuloksista viestiminen

Yhteistyökumppanit

Lundin yliopisto (LU), Ruotsi (koordinaattori)
National Institute for Medical Research (NIMR), Tansania
Centre National de la Recherche Technologique et Scientifique (CNRST/IRSS-DRCO), Burkina Faso
University of Kinshasa (UNIKIN), Kongon demokraattinen tasavalta
Flanders Institute for Biotechnology (VIB), Belgia
Ghentin yliopisto (UGENT), Belgia
Norwegian Research Centre (NORCE), Norja
The Global Health Network (TGHN), University of Oxford, Iso-Britannia