Koronaviruksen jätevesiseuranta: omikronvariantin XBB-alalinjaa havaittu jätevedessä, seurantatuloksia seuraavan kerran tammikuussa

22.12.2022

Koronaviruksen jätevesiseurannassa on havaittu omikronvariantin uutta XBB-alalinjaa. Ensimmäiset jätevesihavainnot XBB:stä tehtiin Espoossa ja Helsingissä lokakuun lopussa, ja alalinja otettiin mukaan jätevesiseurannan raportointiin joulukuussa. Viimeisimmät jätevesien varianttitulokset ovat 28.11.kerätyistä näytteistä.

XBB on omikronvariantin alalinjojen BA.2.10.1 ja BA.2.75 yhdistymisestä muodostunut rekombinanttialalinja.

Sitä on havaittu myös henkilötestauksen sekvensoiduissa näytteissä lokakuun lopusta saakka. Sen osuus ei kuitenkaan näyttäisi kasvavan kovin nopeasti.

Suomessa liikkuu tällä hetkellä useita omikronvariantin alalinjoja. Uusien varianttien ja alalinjojen muodostuminen on osa virusten luonnollista evoluutioprosessia. Tällä hetkellä ei ole viitteitä sellaisista varianteista tai alalinjoista, jotka aiheuttaisivat tavanomaista vakavampaa tautia.

”Suomen jätevedestä havaitaan nyt omikronvariantin BA.2 -alalinjasta polveutuvia XBB- ja BA.2.75-alalinjoja sekä BA.4- ja BA.5-alalinjoja. Omikronvariantin alalinjojen suhteellisissa osuuksissa ei ole tapahtunut merkittäviä muutoksia heinäkuun jälkeen, mistä alkaen BA.5 ja siitä polveutuvat alalinjat ovat olleet yleisimpiä jätevesissä havaittuja alalinjoja”, sanoo THL:n erikoistutkija Anssi Lipponen.

Monet BA.5:n alalinjat ovat päälinjan kanssa hyvin samankaltaisia eikä niiden erottaminen jätevesinäytteissä toisistaan ole tällä hetkellä mahdollista.

SARS-CoV-2-virusmuunnosten suhteelliset osuudet Suomen jätevesinäytteissä seurannassa olevien puhdistamojen alueilta yhteensä ajanjaksolla 2.5.– 28.11.2022 sekvensoiduissa jätevesinäytteissä. Haaleampi osa kuvaa keskihajontaa eri puhdistamoiden tuloksista. Omikron BA.5 -alalinja on tällä hetkellä selkeästi yleisin jätevesinäytteissä. Seurannassa ovat olleet mukana myös linjat XBB, BA.2, BA.4 ja BA.2.75, joiden suhteelliset osuudet ovat pysyneet alhaisina.

Koronaviruksen RNA:n eli perimän lukumäärissä Suomen jätevesissä on ollut nähtävissä melko tasainen loivasti nouseva trendi koko syyskauden ajan. Tuoreimmat jätevesinäytteet kerättiin 18.–19.12.2022, ja viikkoraportti julkaistaan tällä viikolla poikkeuksellisesti jo torstaina 22.12.

Koronavirusmäärien nousu jätevedessä viittaa syksyn ja alkutalven tyypilliseen infektiokauteen, joka näkyy myös muiden hengitystieinfektioiden lisääntymisenä. Vastaavaa nousua ei näy laboratoriovarmistetuissa koronatapauksissa, sillä terveydenhuollossa koronatestejä tehdään vain rajatusti muun muassa oireisille vakavan koronataudin riskiryhmiin kuuluville.

Vuodenvaihteessa muutoksia jätevesiseurannan toteutukseen

THL:n jätevesiseurannassa käytettävää jätevesinäytteiden esikäsittelymenetelmää on loppuvuoden aikana kehitetty. Uusi menetelmä ei ole yhtä herkkä tarvikkeiden saatavuusongelmille kuin nykyisin käytettävä menetelmä.

Uuden menetelmän mukaiset jätevesiseurannan tulokset raportoidaan ensimmäistä kertaa 13.1.2023.

Koronaviruksen jätevesiseuranta on tauolla kaksi viikkoa ajalla 23.12.2022–7.1.2023.

Espoossa otetaan parhaillaan käyttöön uutta Blominmäen jätevedenpuhdistamoa. Blominmäen puhdistamon jätevesitulokset sisällytetään viikkoraporttiin joulutauon jälkeen.

Puhdistamo käsittelee Espoosta ja Kauniaisista, Kirkkonummelta, Siuntiosta sekä Länsi-Vantaalta noin 400 000 asukkaan jätevedet, jotka on aikaisemmin käsitelty Suomenojan jätevedenpuhdistamolla. Uuden puhdistamon käyttöönoton vuoksi Espoon Suomenojan jätevedenpuhdistamon tuloksia ei ole mukana loppuvuoden viikkoraporteissa.

Lisätietoja

Anssi Lipponen
Erikoistutkija
THL
029 524 7962
[email protected]

Infektiotaudit ja rokotukset Pääsivusto anssi.lipponen - thlfi koronavirus - thlfi