Uppföljningen av coronavirus i avloppsvattnet: de nya undergrupper av omikron är de vanligaste coronavirusvarianterna i Finland

Utifrån resultaten från Institutet för hälsa och välfärds (THL) uppföljning av coronavirus i avloppsvattnet är omikronvariantens undergrupper BA.4/BA.5 vanligare i Finland än BA.2-undergruppen. Utgående från midsommarens avloppsvattendata från uppföljningsorterna, överskrider den relativa totala andelen BA.4/BA.5-spesifika mutationer de BA.2 spesifika mutationerna. Samtidigt (vecka 25) blev BA.4/BA.5-undergrupperna de dominerande virtusen även enligt sampeluppföljningen av variantsekvenseringen som omfattar hela landet och som man gör på laboratoriebekräftade covid-19-prover.

Med uppföljningen av avloppsvattnet kartlägger man den totala mängden av coronavirusets arvsmassa (RNA) och de relativa andelarna av olika coronavirusvarianter i avloppsvattnet i Finland. Mängden RNA i avloppsvattnet har varit fortsatt hög, det vill säga att det fortfarande finns mycket smitta bland befolkningen. Eftersom en stor del av smittorna endast konstateras med hemmatester, förblir mängden av laboratoriebekräftade fall låg och reflekterar inte den verkliga epidemisituationen.

När virusen replikeras i de infekterade cellerna uppstår det förändringar i deras genom, alltså mutationer. Mutationerna är en del av virusens naturliga evolutionsprocess. Det är tills vidare inte möjligt att skilja på BA.4- och BA.5-undergrupperna fråmn varandra i avloppsvattenundersökningarna på grund av likheter i varianternas arvsmassa. 

De första observationerna av de nyaste undergrupperna var i maj

BA.4/BA.5-undergrupperna av omikron observerades första gången i Finland mellan den 8 och 9 maj 2022 i avloppsvatten från Kuopio. Fram till slutet av maj kunde BA.4/BA.5-varianterna redan observeras i avloppsvatten från tio olika uppföljningsorter. De nyaste sekvenseringsresultaten är från avloppsvattenprover som samlats in i mitten av juli 2022, och då konstaterades de nya omikron undergrupperna vara de mest förekommande varianterna på alla orter som är med i THL:s avloppsvattenuppföljning. 

De relativa andelarna av SARS-CoV-2-virusvarianter i avloppsvattenproverna från områdena kring de reningsverk som följs upp i Finland sammanlagt i de avloppsvattenprover som sekvenserats under perioden från den 1 januari till den 18 juli 2022. De bleka områdena på bilden beskriver standardavvikelsen i resultaten från de olika reningsverken. 

De första tecknen på BA.2-underlinjen av omikron i Finlands avloppsvatten kommer från prover som samlades in mellan den 2 och 3 januari 2022 från avloppsreningsverken i Kuopio och Villmanstrand. Underlinjen i fråga var det dominerande viruset från början av maj till slutet av juni. Av de avloppsvattenprover som samlades in mellan den 17 och 18 juli kunde BA.2-underlinjen nu endast observeras i avloppsvattnet i Kuopio.

Läs mer: Varianter av coronaviruset i avloppsvattnet 

Uppföljningen av avloppsvattnet fortsätter varje vecka, uppföljningsorterna blir färre

Uppföljningen av coronavirus i avloppsvattnet fortsätter med insamling av prover varje vecka och efter sommarens paus i rapporteringen kommer resultaten igen att publiceras en gång i veckan på fredagar kl. 12.

I september 2022 kommer uppföljningen att begränsas på så sätt att man i fortsättningen varje vecka undersöker RNA-antalet i avloppsvattnet på nio orter. Samtidigt sjunker den riksomfattande befolkningstäckningsgraden från 50 procent till ungefär 45 procent.

Från och med provtagningen den 4 till 5 september 2022 lämnar man bort avloppsreningsverken i Luotsimäki i Björneborg, Paroinen i Tavastehus och Mäkikylä i Kouvola. Dessutom glesar man ut provtagningen i avloppsreningsverken i Toikansuo i Villmanstrand och Alakorkalo i Rovaniemi till en gång i månaden.

Uppföljningen av de andra avloppsreningsverken som är med i uppföljningen fortsätter i samma takt som för närvarande på hösten 2022. Från och med den 4 september 2022 samlar man in prover från avloppsreningsverken i Esbo, Helsingfors, Joensuu, Jyväskylä, Kuopio, Uleåborg, Tammerfors, Åbo och Vasa varje vecka. Dessutom samlar man in prover från Rovaniemi, Villmanstrand, Jakobstad och Seinäjoki en gång i månaden.

Coronavirusets RNA-antal som observerats i proverna uppdateras på THL:s webbplats i veckorapporten om uppföljningen av avloppsvattnet. De ändringar som görs i uppföljningen kommer för första gången att ses i veckorapporten fredagen den 9 september 2022. De avloppsvattenprover där man observerar coronavirusets RNA skickas för sekvensering för att identifiera varianter av coronaviruset.

Den här veckan (7.8–8.8.2022) var den ökande trenden av RNA-antalet från de fem senaste mätningsgångerna på en jämn men hög nivå i de reningsverk som är med i uppföljningen av avloppsvattnet. Den ökande trenden från de fem senaste mätningarna fortsatte i Jyväskylä, men ökningen hade jämnats ut i Kuopio och Tammerfors. Mängden RNA var på en fortsatt hög nivå i Esbo, Rovaniemi, Åbo och Vasa. I avloppsvattnet i Tavastehus, Joensuu, Villmanstrand och Uleåborg hade RNA-antalet däremot börjat sjunka och den sjunkande trenden hade fortsatt i Helsingfors och Kouvola.

Lägesbilden av mängden coronavirus som uppföljningen av avloppsvattnet ger är oberoende av testaktiviteten och stöder andra epidemiparametrar. 

Mer information

• Mer information om varianter av coronaviruset i avloppsvattnet 
• Veckorapport om uppföljningen av coronavirus i avloppsvatten (på finska)
• Coronavirusvarianter 

Tarja Pitkänen
ledande expert
THL
tfn 029 524 6315
[email protected]

Anssi Lipponen 
specialforskare
THL
tfn 029 524 7962
[email protected]