Omikron BA.2 är nu den vanligaste varianten av coronaviruset som observerats i avloppsvattnet i Finland

12.4.2022

Av resultaten från Institutet för hälsa och välfärds (THL) uppföljning av avloppsvattenresultaten framgår det att undervarianten BA.2 av omikron är den vanligaste varianten av coronaviruset som observerats i avloppsvattnet i Finland. Genom att sekvensera de prover som samlats in i THL:s uppföljning av avloppsvattnet kan man identifiera coronavirusvarianternas andel av coronavirus-RNA i avloppsvattnet, dvs. virusets arvsmassa.

Enligt uppföljningen av avloppsvattnet var deltavarianten i Finland den vanligaste varianten fram till mitten av december 2021. I början av januari 2022 observerades att varianten BA.1 av omikron blev vanligare än deltavarianten i avloppsvattnet. I mitten av mars var det däremot vanligast med undervarianten BA.2 av omikron.

Det är möjligt att identifiera varianter av coronaviruset i avloppsvatten med avancerade sekvenseringstekniker, även om virus-RNA, är utspädd i avloppsvattnet och kan ha skadats av miljöfaktorer. THL började utveckla metoden för att identifiera varianter av coronaviruset i avloppsvattenprover i slutet av förra året. Metoden har utvecklats för att identifiera undervarianterna BA.1 och BA.2 av omikron, samt för att fastställa de olika varianternas relativa andelar.

Deltavarianten var vanligast fram till mitten av december, i början av januari blev varianten BA.1 av omikron den vanligaste coronavirusvarianten i Finlands avloppsvatten och i mitten av mars överskred den undre linjen av omikron BA.2 förekomsten av underlinje BA.1 i Finlands avloppsvatten.

De relativa andelarna av SARS-CoV-2-virusvarianter i de reningsverks områden som övervakas i Finlands avloppsvattenprover sammanlagt i de avloppsvattenprover som sekvenserats under perioden 1.11.2021 – 14.3.2022.

De första hänvisningarna till undervarianten BA.1 av omikron i Finlands avloppsvatten kom från ett prov av orenat avloppsvatten i Esbo som hade samlats 6.–7.12.2021. Under tidigare veckor och på andra uppföljningsorter observerades inte denna underlinje ännu då, även om man redan den veckan i Viksbacka i Helsingfors fick tecken på förekomsten av omikronvarianten. Till dessa delar har resultaten preciserats från tidigare preliminära resultat.

Enligt de hittills sekvenserade proverna fick man de första hänvisningarna till varianten BA.2 av omikron från Tammerfors avloppsreningsverk 2-3.1.2022.

I januari-februari 2022 blev förekomsten av undervarianterna BA.1 och BA.2 av omikron vanligare runtom i Finland, och under perioden 20.–21.2.2022 observerades båda varianterna samtidigt i avloppsvattenprover från hela 13 olika orter.

Enligt de hittills färdiga sekvenseringsresultaten kunde man observera de sista hänvisningarna till deltavarianten i Finlands avloppsvatten i prover som samlats in 16. –17.1.2022.

Alla insamlade avloppsvattenprover har ännu inte analyserats för variationer av coronaviruset. För närvarande ger metoden för identifiering av varianter endast preliminära resultat av avloppsvattnet, och till och med en månads sekvenseringsfördröjning förhindrar slutförandet av resultaten.

Läs mer: Varianter av coronaviruset i avloppsvattnet

Virusvarianterna följs också upp nationellt i laboratoriebekräftade covid-19-prover genom att sekvensera ett urval av coronavirus som konstaterats vid persontest i olika delar av landet. På motsvarande sätt som avloppsvattenresultaten visade, blev BA.1. i slutet av december (vecka 51) vanligare än deltavarianten enligt en sampeluppföljning som omfattade hela landet. BA.2. växte å sin sida till det dominerande viruset, vanligare än BA.1. i slutet av mars (vecka 10). Inom Helsingfors och Nylands sjukvårdsdistrikt (HUS) har BA.2 varit det dominerande viruset sedan början av året.

Uppföljningen av avloppsvattnet fortsätter varje vecka

Uppföljningen av coronavirus i avloppsvattnet fortsätter med insamling av prover varje vecka. På basis av de senaste avloppsvattenproverna, dvs. de som samlats in 3.–4.4.2022, är det totala antalet av coronavirusets RNA i avloppsvattnet fortfarande på en hög nivå.

Förra veckan (3-4.4.2022) uppmättes i Jyväskylä, Kuopio, Tammerfors och Vasa de högsta RNA-antalen i mätningshistorien per 1000 personer per dygn. Den uppåtgående trenden med RNA-antalet från de fem senaste mätningarna i Rovaniemi har fortsatt att stiga den här veckan. Trenden för de fem sista mätningarna i Joensuu har börjat minska. På de övriga uppföljningsorterna är RNA-mängden hög, men trenden har hållits på en jämn nivå under de två senaste veckorna.

Läs mer: Veckorapport om uppföljningen av coronavirus i avloppsvatten (på finska)Länk till en annan webbplatsÖppnas i en ny flik

Lägesbilden av mängden coronavirus som uppföljningen av avloppsvattnet ger är oberoende av testaktiviteten och stöder andra epidemiparametrar.

Coronavirusets RNA-antal undersöks varje vecka i avloppsvattenprover från 13 orter. Proverna har samlats in från avloppsreningsverken i Esbo, Helsingfors, Tavastehus, Joensuu, Jyväskylä, Kouvola, Kuopio, Villmanstrand, Uleåborg, Björneborg, Tammerfors, Åbo och Vasa. Dessutom samlar man in prov från Rovaniemi med två veckors mellanrum samt från Jakobstad och Seinäjoki en gång i månaden.

Coronavirusets RNA-antal som observerats i proverna uppdateras på THL:s webbplats i veckorapporten om uppföljning av avloppsvatten en gång i veckan på fredagar kl. 12. Resultaten från de prov som samlas in den 10.–11.4.2022 under påskveckan uppdateras undantagsvis på webbplatsen redan torsdagen den 14.4.2022. De avloppsvattenprover i vilka coronavirusets RNA observeras skickas för sekvensering för att identifiera varianter av coronaviruset.

Mer information

Tarja Pitkänen
ledande expert
THL
tfn 029 524 6315
fornamn.efternamn@thl.fi

Anssi Lipponen
specialforskare
THL
tfn 029 524 7962
fornamn.efternamn@thl.fi

Huvudwebbplats Infektiotaudit ja rokotukset Ympäristöterveys korona - thlfi-sv