Rotavirusgenotyypit
Sivun sisältö:
- Rotavirusten seuranta
- Rotavirusgenotyypit 2019
- Rotavirusgenotyypit 2018
- Rotavirusgenotyypit 2013‒2017
Rotavirusten seuranta
THL on ylläpitänyt vuodesta 2013 alkaen tartuntalain ja -asetuksen mukaista rotavirusten kantakokoelmaa ja seuraa eri rotavirustyyppien esiintyvyyttä Suomessa.
Kliinisten laboratorioiden THL:ään lähettämät rotaviruspositiiviset löydökset tyypitetään molekyyligeneettisesti Tampereen yliopiston Rokotetutkimuskeskuksessa.
Lisätietoa rotavirusten genotyypeistä:
Rotavirusinfektioiden seurantakäsikirja (sivut 6–7)
Tartuntatautirekisteriin ilmoitetut rotavirustapaukset ja THL:ään lähetetyt rotaviruspositiiviset näytteet 2019. Tartuntalain ja -asetuksen mukaan rotaviruspositiiviset löydökset on ilmoitettava tartuntatautirekisteriin ja niistä on lähettävä kantakokoelmanäyte THL:ään.
Rotavirusgenotyypit 2019
Kesäkuun loppuun mennessä THL:ään oli lähetetty 121 rotaviruspositiivista löydöstä, joka vastaa 80 prosenttia tartuntatautirekisteriin vuonna 2019 ilmoitetuista rotavirustapauksista.
Kesäkuun loppuun mennessä vuonna 2019 yleisimmät rotaviruksen genotyypit Suomessa ovat
- G2P[4]
- G9P[8] ja
- G9P[4].
Seuraavaksi yleisimmät genotyypit olivat G3P[8], G4P[8], G3P[4], G8P[8] ja G12P[8].
Rotaviruksen genotyypitys tehtiin 46:sta kantakokoelmanäytteestä.
Rotavirusgenotyypit 2019 taulukkomuodossa
Rotavirusgenotyypit 2018
Vuonna 2018 yleisimmät rotaviruksen genotyypit Suomessa olivat
- G12P[8] (144 tapausta)
- G9P[8] (71 tapausta).
Näiden osuus infektioista on lisääntynyt jatkuvasti.
Seuraavaksi yleisimmät genotyypit olivat G3P[8], G9P[4], G2P[4], G1P[8] ja G4P[8].
Kolmessakymmenessä tapauksessa löytyi hevosen rotavirus G3P[8], mikä on zoonoottinen eli eläimestä peräisin oleva.
Rotaviruksen genotyypitys tehtiin 325:sta kantakokoelmanäytteestä.
Rotavirusgenotyypit 2018 taulukkomuodossa
Rotavirusgenotyypit 2013‒2017
Vuosien 2013‒2017 yleisimmät genotyypit olivat
- G2P4
- G1P[8] ja
- G9P[8].
Seuraavaksi yleisimmät genotyypit olivat G3P[8], G12P[8], G9P[4], G4P[8].
Suomessa on havaittu myös harvinaisia viruksia kuten G3P[6], G3P[9], G4P[10], G6P[8], G6P[14], G8P[4], G8P[8] ja G8P[14]. G3P[8]-löydöksiä oli yhteensä 98.
Vuonna 2015 ja 2016 Suomessa on kiertänyt harvinaisempia viruksia, kuten eläimen ja ihmisen reassortanttivirus G6P[8] sekä mahdollisesti eläimistä peräisin oleva virus G29P[9].
Zoonoottisten virusten, mahdollisesti hevosesta peräisin olevien virusten, määrä on lisääntynyt.
Vuonna 2017 viidessä tapauksessa oli kaksoisinfektio. Kaksoisinfektioista vastuussa olevat virusparit olivat G9+G3P[4]+P[8]; G3+G12P[8]; G3+G12P[8]; G2+G12P[4]; G4+G9P[8].
