Toimintakertomus 2021
THL Biopankki toimii osana Terveyden ja hyvinvoinnin laitosta (THL) ja pyrkii toiminnallaan edistämään valtakunnallisesti merkittävien tutkimusaineistojen hyödyntämistä sairauksien ehkäisyssä ja terveyden edistämisessä. Vuoteen 2021 mennessä THL Biopankkiin oli kertynyt näytteitä ja tietoja yli 220 000 luovuttajalta 35 eri tutkimushankkeesta.
THL Biopankin aineistojen käyttö 2021
THL Biopankin toiminnan alkamisesta lähtien suurin osa tutkimushakemuksista on kohdistunut THL:n keräämiin väestötutkimusaineistoihin; viiden vuoden välein kerättyyn kansalaisten terveysseuranta-aineisto FINRISKI:in (1992-2012) sekä Terveys 2000- ja Terveys 2011 -seurantatutkimusaineistoihin. Näiden laajojen väestötutkimusaineistojen yhteydessä kerätyt elintapatiedot näytteenantajista koskien mm. ravitsemusta, liikuntatottumuksia, tupakointia ja terveydentilaa, muodostavatkin yhdessä myöhemmin tuotettujen genomitietojen kanssa THL Biopankin aineistojen kivijalan.
Kansallinen FINRISKI-tutkimus THL Biopankissa
Terveys2000/2011 -tutkimukset THL Biopankissa
THL Biopankin suurin yksittäinen biopankkiprojekti vuonna 2021 oli edelleen FinnGen. Vuonna 2017 käynnistynyt FinnGen-tutkimus on julkisen ja yksityisen sektorin yhteinen, laaja biopankkitutkimushanke, joka pyrkii sairausmekanismien parempaan ymmärtämiseen yhdistämällä genomi- ja terveystietoa jopa 500 000 suomalaisesta. THL Biopankin laboratorio huolehtii koko projektin näytelogistiikasta myös muiden suomalaisten biopankkien puolesta. Laboratoriossamme prosessoitiin kuluneena vuonna lähes 64 000 näytettä FinnGen-projektiin. FinnGen-hankkeessa tuotettu genomitieto palautuu biopankkeihin käytettäväksi uusiin biopankkitutkimuksiin.
Lue lisää FinnGen-tutkimuksesta
Vuonna 2021 THL Biopankissa käsiteltiin 67 biopankkiaineistoon kohdistuvaa esiselvityspyyntöä. Luovutuspyyntöjä varsinaisiin tutkimushankkeisiin saapui THL Biopankkiin 20 kappaletta. Uusia hankkeita käynnistyi vuoden aikana 12 ja yhteensä käynnissä olevia biopankkiprojekteja oli vuoden 2021 lopussa noin 50. Biopankista luovutettiin vuoden aikana näytteitä ja tietoja yhteensä 24 biopankkiprojektiin: yli 10 000 näytettä sekä yli 260 datasettiä, jotka sisälsivät yli 1 200 000 näytteenantajan tietoja (sisältää päällekkäisyyksiä). Lisäksi yli 100 000 biopankissa olevan henkilön tietoja käytettiin neljässä biopankin yhteistyöprojektissa.
Kuvaukset THL Biopankissa hyväksytyistä biopankkiprojekteista
Biopankkiaineistoja käytettiin monissa korkealaatuisissa tieteellisissä tutkimuksissa, joiden pohjalta syntyi myös lukuisia merkittäviä julkaisuja. HUS Neurokeskuksen ja Helsingin yliopiston yhteistyönä toteuttamassa tutkimuksessa hyödynnettiin THL Biopankin aineistoja sopivien tutkittavien löytämiseksi uuteen seulontatutkimukseen. Tupakoivilta vaihdevuosi-ikäisiltä naisilta löytyi toteutetussa pilottitutkimuksessa yllättävän paljon aivovaltimopullistumia.
Tutustu uusimpiin biopankkitutkimuksista tuotettuihin julkaisuihin (englanniksi)
Lue lisää aivovaltimopullistumien seulontatutkimuksesta
THL Biopankin aineistot rikastuivat
THL Biopankkiin palautui vuonna 2021 runsaasti biopankkitutkimuksissa tuotettua genomitietoa sekä seeruminäytteistä tehtyjä määrityksiä, joita voidaan edelleen hyödyntää tulevissa tutkimuksissa.
Lisäksi biopankin laboratoriossa valmistui haastava urakka, jossa biopankkitutkimusta varten eristettiin DNA-näytteet lähes 20 000 vanhasta verinäytteestä, joita oli säilytetty pakkasissa 30-40 vuotta odottamassa tulevia tutkimuksia. Sekä syntyneet DNA-näytteet, että biopankkitutkimuksesta palautunut geneettinen tieto ovat jatkossa käytettävissä biopankin kautta uusiin tutkimuksiin.
THL Biopankin tutkimuskokoelmat rikastuivat kuluneena vuonna myös nuorten luovuttajien näytteillä, kun Folkhälsanin omistama Hyvinvointi Teini-iässä -tutkimusaineisto (Fin-HIT) siirrettiin biopankkiin näytteenantajien antamalla biopankkisuostumuksella. Biopankkiin siirretty kokoelma sisältää tällä hetkellä näytteitä ja tietoja seurantatutkimuksen ensimmäisestä vaiheesta, jolloin osallistujat olivat 9-12-vuotiaita. Kokoelma sisältää myös lasten vanhempien näytteitä. Aineisto on tervetullut lisä THL Biopankkiin, sillä tällä hetkellä suuri osa THL Biopankin näytteenantajista on yli 70-vuotiaita.
Fin-HIT-tutkimus THL Biopankissa
THL Biopankin kehitys- ja laatutyö
Vuonna 2020 käynnistetty laaja biopankin sisäisten prosessien ja dokumentaation uudistamistyö saatiin valmiiksi vuoden 2021 lopulla. Uudistuksen seurauksena monia prosesseja ja menettelytapoja sujuvoitettiin ja yhdenmukaistettiin, minkä seurauksena biopankkitoimintaa voidaan tehdä entistä laadukkaammin.
Lääkealan turvallisuus- ja kehittämiskeskus Fimea suoritti biopankin toimintaa koskevan viranomaistarkastuksen THL Biopankkiin 23.11.2021. Tarkastuksessa todettiin, että THL Biopankki toimii biopankkilain mukaisesti. Tarkastuksessa ei ilmennyt kriittisiä puutteita biopankin toiminnassa, mutta todettiin muutamia kehityskohteita. Biopankki jatkaa laatutyötään mm. uudistamalla hakemusten arviointiprosessia, parantamalla dokumentaatioita ja täsmentämällä näytteiden säilytyksen lämpötilaseurantaa.
Yhteistyö biopankkiverkostoissa
THL Biopankki oli edelleen aktiivisesti mukana Suomen biopankkien osuuskunnan, FINBB:n toiminnassa, etenkin sen puitteissa toimivien erilaisten työryhmien kautta. THL Biopankin asiantuntijat osallistuivat kansalliseen yhteistyöhön mm. IT-kehitykseen, laatutyöhön, viestintäasioihin ja asiakasprojekteihin liittyen. FINBB-yhteistyön tavoitteena on Suomen biopankki-infrastruktuurin kehittämisen lisäksi edistää THL Biopankin aineistojen näkyvyyttä ja saavutettavuutta FINBB:n ylläpitämän Fingenious-palvelun kautta. Aktiivinen yhteistyö suomalaisessa biopankkiverkostossa kantoi hedelmää myös vuonna 2021 ja THL Biopankki valittiinkin uudelleen vuoden ”Yhteistyön voimistaja” -biopankiksi, tällä kertaa yhdessä Auria biopankin kanssa.
Suomen biopankkien osuuskunta FINBB
Suomalaiset biopankit Fingenious-palvelussa (englanniksi)
THL Biopankki osallistui myös erilaisiin, biopankkitoimintaan tai siihen läheisesti liittyviin kehityshankkeisiin, kuten BBMRI-ERIC CS-IT:n johtamaan biopankkeja kuvaavan MIABIS-sanaston kehitystyöhön, biopankkia palvelevien tiedonhallintaratkaisujen kehittämiseen yhdessä Tieteen tietotekniikan keskuksen (CSC) kanssa, sekä genomikeskusta valmistelevan työryhmän toimintaan.
Lisäksi THL Biopankki tuki edelleen vuonna 2021 THL:n COVID-19-tutkimusta tarjoamalla näytekäsittelyä sekä tietojärjestelmätukea mm. suostumusten hallintaan.
Yhteystiedot ja ajankohtaista
Lue lisää THL Biopankin ajankohtaisista uutisista
THL Biopankin ajankohtaisia asioita voi seurata myös Twitterissä (@THLBiopankki)