Insändning av prover för coronavirussekvensering

Syftet med coronavirussekvenseringen, dvs. uppföljningen av  coronavirusstammarnas genetiska variation, är att upptäcka nya virusvarianter och följa upp hurdana coronavirusstammar som förekommer i Finland.

Coronavirussekvensering görs tillsvidare.

Vilka prover sekvenseras?

Till sekvensering skickas coronaviruspositiva prover som tagits av personer som anlänt från utlandet eller deras närkontakter.

  • Alla prover med positivt resultat som tagits vid gränsövergångsställen
  • Prover från närkontakter som hittats vid smittspårning. Familjemedlemmarnas prover sekvenseras inte i första hand.

För epidemiologisk uppföljning sekvenseras följande prover:

  • Prover som tagits av avvikande smittokluster, till exempel på vårdinrättningar och skolor eller i situationer där en betydande ökning av antalet smittade observerats.
  •  Coronaviruspositiva prover som konstaterats i sydvästra Lappland. Med hjälp av dessa följer man upp virusstammar som kommer från Sverige.
  • Fem coronaviruspositiva prover per vecka från samtliga laboratorier. Proverna kan härstamma från personer i den öppna vården eller i sjukhusvården. Proverna ska vara separata, oberoende av varandra. Till exempel får det endast finnas ett prov från samma familj eller samma vårdavdelning.

Var utförs sekvenseringen av coronavirusstammar?

I nuläget sekvenseras coronavirusstammar  på Helsingfors universitet laboratorium och på THL:s laboratorium i Helsingfors. Senare börjar man också sekvensera coronavirusstammar på laboratoriet för klinisk mikrobiologi vid Åucs.

Coronaviruspositiva prover i samkommunen HNS upptagningsområde och de prover som gett positivt resultat  vid gränstestningsställen som administreras av HNS sekvenseras på Helsingfors universitets laboratorium. Proverna skickas till Helsingfors universitet via HUSLAB för sekvensering.

Coronaviruspositiva prover från övriga Finland skickas till THL för sekvensering enligt adressen nedan:

THL
Mikrobiologisk expertis
Virologi/UK sekvensering
PB 30
00271 Helsingfors