Laboratorieundersökningar av MERS-coronavirus

Mikrobiologiska undersökningar vid misstanke om MERS-coronavirus (MERS-CoV; tidigare nCov-EMC) 

MERS-coronavirusdiagnostik ska begäras endast efter att en infektionsläkare konsulterats.

Rekommenderade mikrobiologiska undersökningar av MERS-coronavirus

Innan prov skickas till laboratorieenheter för klinisk mikrobiologi ska deras diagnostikberedskap utredas.

RNA-test (begäran ZoonNhO, KL nr 20857) av MERS-coronaviruset (hCov-EMC)

För RNA-påvisningsundersökningar av MERS-coronavirus tas alltid parallella prov som skickas till det virologiska laboratoriet vid THL:s enhet för mikrobiologisk expertis. 

THL:s virologiska laboratorium måste ovillkorligen kontaktas innan proven skickas in. Kontaktuppgifter finns i slutet av anvisningen.

Diagnostiska prover ska i första hand tas i de nedre luftvägarna (BAL- eller upphostningsprov).

Virusodlingsundersökningar, även differentialdiagnostiska virusodlingar, ska endast utföras i laboratorier som uppfyller kriterierna för skyddsklass 3 (BSL-3). Av MERS-positiva virusodlingar skickas ett prov till THL.

Skyddsnivåkrav för virusodling

Från fall till fall kan man efter att ha konsulterat en infektionsläkare göra andra differentialdiagnostiska bestämningar som t.ex.

1. Blododling x 2 (B-BaktVi, KL nr 1153)

2. Av prov som tagits med nasofarynxpinne eller nasofarynxsug eller av upphostningsprov

-  Påvisning av respiratoriska virusantigener (- RvirAg, KL nr 2579). Finns enbart som jourundersökning

- Genamplifieringsundersökningar:

• Respiratoriska virus, nukleinsyra (kval, RVirNhO, KL nr 20956)
• Influensa A, B och RSV, nukleinsyra (kval, InABRSV, KL nr 21373). 
• Influensa A-virus, variant, nukleinsyra (kval, InfvNhO, KL nr 6133)
• Picornavirus, nukleinsyra (kval, PicoNhO, KL nr 1917)
• Mycoplasma pneumoniae, nukleinsyra (kval, MypnNhO, KL nr 4439)
• Chlamydia pneumoniae, nukleinsyra (kval, ChpnNhO, KL nr 4384)
• Mycoplasma pneumoniae och Chlamydia pneumoniae, nukleinsyra (kval) och Mycoplasma pneumoniae-känslighet (MyHeCp, KL nr 21356)

3. Urinprov

• Legionellaantigen i urin (U-LepnAg, KL nr 4632)
• pneumokockantigen (U-StpnAg, KL nr 8291)

4. Serumprov i akut- och konvalescensfasen (parade serumprover tagna med 14 dygns intervall)

• virusantikroppar (S-VirAb, KL-nr 2967)
• Mycoplasma pneumoniae-antikroppar (S-MypnAb, KL nr 2367)
• antikroppar mot Chlamydia (S-ChlaAb, KL nr 2060)
• antikroppar mot Legionella (S-LegiAb, KL nr 2205)

5. Avföringsprov

• virusodling x 1 (-VirVi, KL nr 2975)

6. Andra behovsprövade laboratorieundersökningar:

• Malariaplasmodium (B-Plas-O, KL nr 2315), alltid av patienter med feber som har kommit från malariaområden
• antikroppar mot Q-feber (S-CobuAb, KL nr 2557)
• antikroppar mot salmonella (S-SalmAb, KL nr 2607)
• Legionellaodling (-LegVi, KL nr 2206) och -färgning (-LepnVr, KL nr 3219)

Tagning, packning och transport av prov

De som tar proven ska skydda sig på samma sätt som den övriga personalen. De respiratoriska proven tas på vårdavdelningen.

Mer information i följande avsnitt:

Anvisningar för förebyggande och bekämpning av infektioner

Sedvanliga försiktighetsåtgärder och skyddsklassificering

Anvisningar för provtagning

PRIMÄRT PROV:

Upphostnings- eller BAL-prov: Som prov behövs 2 ml upphostning eller BAL-prov. Provet skickas som sådant i ett slutet fabriksrent rör försett med skruvkork eller motsvarande burk. Provet håller 1–3 dygn i kylskåp.

SEKUNDÄRT PROV:

Om det inte är möjligt att ta ett upphostnings- eller BAL-prov, kan undersökningen göras med ett prov från en nasofarynxsug eller ett nasofarynxpinnprov. 

Om undersökning önskas av flera olika provkvaliteter, ska de skickas till laboratoriet samtidigt. För varje provkvalitet ska det göras en egen ZoonNhO-begäran.

Prov med nasofarynxsug:

• Fukta näsborrarna vid behov med ca 2 ml koksalt. 
• För in ett slemprovrör som kopplats till en sug via näsan in i nasofarynx och sug ut slem i provröret från båda näsborrarna. 
• Skicka slemprovet (2 ml) som sådant i sleminsamlingsprovröret helst samma dag. Provet håller 1–3 dygn i kylskåp.

Nasofarynxpinnprov

• För in en nasofarynxpinne (helst nylon eller en dacronpinne) snett nedåt längs näsbottnen i näsborren till ca 12‒15 cm djup (djupet mäts på förhand, näsborre-örsnibb; hos vuxna alltid >10 cm, hos barn under 2 år 6‒7 cm)
• Gnid slemhinnorna med en roterande rörelse så att det fastnar celler från slemhinnan på pinnen.
• Om patienten lätt blöder eller situationen annars kräver det, kan du ta ett pinnprov från 3–5 cm djup i näsborren och med en separat pinne från svalgbågen. 
• Båda pinnarna kan brytas i ett provrör som innehåller transportvätska (t.ex. sterilt koksalt eller virusodlingsvätska). 
• Ovan nämnda provrör för virustransport finns även till salu kommersiellt, t.ex. Copan® UTM (Universal transport medium). 
• OBS! Transportrör som är avsedda för bakterieprov (t.ex. provrör med gel) kan inte användas för transport av virusdiagnostiska prov.

Packning av prov

• Packa proven på samma sätt som smittfarliga prov med hänsyn till gällande anvisningar. 
• Placera varje provrör i ett transportfodral av plast som är försett med skruvkork, linda in röret i cellulosavadd och lägg i en återförslutbar plastpåse. 
• Förse provröret, den återförslutbara plastpåsen och remissen med en gul trekantig etikett, som betyder smittorisk. 
• Skriv ”MERS-epäily” på den återförslutbara plastpåsen. 
• Lägg plastpåsen i en separat transportlåda och placera remissen i transportlådan utanför påsen, gärna i en egen påse. Täta fodral för transport av prov finns hos leverantörer av sjukhus- och laboratoriematerial. 
• OBS! Även differentialdiagnostiska prov ska packas och märkas på samma sätt så länge som misstanken gäller. På provförpackningslådan ska det klart och tydligt antecknas ”INFEKTIOHÄLYTYS”.

Transport av prov till laboratoriet

Patientprov ska skickas till det undersökande laboratoriet som kyltransporter (+4°C). 

För att minimera transportdröjsmål ska proven skickas till det undersökande laboratoriet och från laboratoriet till THL genom specialarrangemang (expresstransport eller taxi). 

Det rekommenderas inte att proven skickas per post. 

Anvisningar om sjukhusets interna provtransporter ges av de berörda enheterna.

Närmare upplysningar

THL, Avdelningen för hälsosäkerhet (under tjänstetid)

Niina Ikonen, tfn 029 524 8413
Carita Savolainen-Kopra tfn 029 524 8884
Jussi Sane tfn 029 524 7406
THL/smittskyddsläkare tfn 029 524 8557

HUSLAB

Hannimari Kallio-Kokko, sjukhusmikrobiolog, tfn 050 427 0476
Laura Mannonen, laborant, tfn 040 838 4009
Maija Lappalainen, överläkare, tfn 040 838 4004
Viruslaboratoriet (PCR-undersökningar), tfn 050 427 2127
Förfrågningar under jourtid (vardagar kl. 15.00–7.00 och veckoslut):
HUSLAB/Virologi, framjouren, tfn 040 837 4010 eller tfn 040 837 4011
HUS jourhavande infektionsläkare tfn (09) 4711