Genomisk uppföljning av SARS-CoV-2

Uppdaterad: 20.12.2024

Sedan december 2020 har man i Finland följt SARS-CoV-2-virusets evolution genom så kallad helgenomsekvensering. Med hjälp av helgenomsekvenser fastställer man de genetiska grupperna av viruset som cirkulerar bland befolkningen samt mutationerna i dem.

THL ansvarar för den nationella genomiska uppföljningen av SARS-CoV-2 viruset i Finland. Välfärdsområden samt laboratorier som deltar i coronavirusdiagnostiken skickar in ett urval av PCR-positiva SARS-CoV-2 prov för sekvensering varje vecka. Den producerade sekvensinformationen innehåller inga personuppgifter.

Helgenomsekvenseringens resultat rapporteras till registret över smittsamma sjukdomar och sammanställs på denna webbplats. På basen av sekvensdatan väljer man också ut virus för laboratorieundersökningar hos THL, bland annat för att utreda virusens förmåga att kringgå immunitet.

Sekvensinformationen som tas fram i Finland kombineras med globala databaser över SARS-CoV-2-virus, som bland annat används till att identifiera nya och potentiellt pandemiska genetiska grupper och till att upptäcka regionala förändringar i prevalensen av individuella undergrupper.

Resultat som baserar sig på sekvensdata och resultat som baserar sig på data från registret över smittsamma sjukdomar kan skilja sig något på grund av raporteringsfördröjningar. Resultaten för den senaste rapporteringsveckan baserar sig ofta på ett relativt litet antal sampel och är därför mindre tillförlitliga än resultat för tidigare veckor.

Lägesöversikt, december 2024

I slutet av år 2024 var nästan alla sekvenserade SARS-CoV-2 sampel undergrupper inom BA.2.86 JN.1. De mest allmänt förekommande undergrupperna var KP.1.1 och XEC. Resultaten motsvarar trender som rapporterats från andra länder i Europa.

SARS-CoV-2-varianterna utvecklas forstättningsvis genom mutationer som förbättrar viruset förmåga att kringgå befolkningens immunitet.  

Enligt WHO:s bedömning, förväntas inte de för närvarande cirkulerande undergrupperna märkbart skilja sig från de tidigare i fråga om folkhälsorisker.

Innehåll

Tabell 1. Andelen (%) genetiska undergrupper av SARS-CoV-2 som observerats bland sekvenserade sampel i Finland

Tabell 1. Innehåll länkat nedan i tillgängligt tabellformat.

Klicka att förstora bilden (png, 239 KB). 

Materialet i Graf 1 i ett tillgängligt tabellformat (csv, 1 KB) 

Graf 1. Distributionen av enskilda genetiska undergrupper bland uppföljningsprov 

Graf 1. Innehåll länkat nedan i tillgängligt tabellformat.

Klicka att förstora bilden (png, 312KB). Förändringen i andelen individuella undergrupper bland uppföljningsprov, per månad. Grafen baserar sig på ett måttligt litet antal observationer, ca 20  sekvenser per vecka.

Materialet i Graf 1 i ett tillgängligt tabellformat (csv, 120 KB) 

Graf 2. Antalet observationer av de genetiska grupperna registrerade i registret över smittsamma sjukdomar, per vecka fr. o. m. november 2020

Graf 2. Innehåll länkat nedan i tillgängligt tabellformat.

Klicka att förstora bilden (png, 93 KB). Antalet fall av VOC (variant of concern) och rekombinanta grupper som registrerats i registret över smittsamma sjukdomar, per vecka. Långtidsgrafen beskriver variantvågorna från och med slutet av 2020, då den nationella genomövervakningen av SARS-CoV-2 inleddes.

Materialet i Graf 2 i ett tillgängligt tabellformat (csv, 120 KB)

Uppdaterad: