Analysutbud

Adenovirus isoleras från hushålls- och naturvattenprover genom att vattenprovet filtreras genom ett filter med positiv laddning.

Vid behov görs en förfiltrering av provet. Från filtret elueras virusen i en buffert med högt pH. För vattenprover av stora volymer (DEUF) elueras patronen i laboratoriet och eluatet koncentreras med polyetylenglykol (PEG)-fällning. Avloppsvattenprovet koncentreras vid behov antingen med PEG-fällning eller med hjälp av metoden för tvåfasseparation. DNA isoleras från koncentratet och den för adenovirus specifika delen av DNA kopieras genom s.k. Real Time-PCR-analys.

Metoden är inte ackrediterad.

Hepatit A-virus isoleras från hushålls- och naturvattenprover genom att vattenprovet filtreras genom ett filter med positiv laddning.

Vid behov görs en förfiltrering av provet. Från filtret elueras virusen i en buffert med högt pH. För vattenprover av stora volymer (DEUF) elueras patronen i laboratoriet och eluatet koncentreras med polyetylenglykol (PEG)-fällning. Avloppsvattenprovet koncentreras vid behov antingen med PEG-fällning eller med hjälp av metoden för tvåfasseparation. RNA isoleras från koncentratet och den för hepatit A-virus specifika delen av RNA kopieras genom PCR med omvänd transkription (RT-PCR) genom s.k. Real Time -PCR-analys.

Metoden är inte ackrediterad.

Norovirus isoleras från hushålls- och naturvattenprover genom att vattenprovet filtreras genom ett filter med positiv laddning.

Vid behov görs en förfiltrering av provet. Från filtret elueras virusen i en buffert med högt pH. För vattenprover av stora volymer (DEUF) elueras patronen i laboratoriet och eluatet koncentreras med polyetylenglykol (PEG)-fällning. Avloppsvattenprovet koncentreras vid behov antingen med PEG-fällning eller med hjälp av metoden för tvåfasseparation. RNA isoleras från koncentratet och den för norovirus specifika delen av RNA kopieras genom PCR med omvänd transkription (RT-PCR) genom s.k. Real Time -PCR-analys.

Metoden är inte ackrediterad.

Rotavirus isoleras från hushålls- och naturvattenprover genom att vattenprovet filtreras genom ett filter med positiv laddning.

Vid behov görs en förfiltrering av provet. Från filtret elueras virusen i en buffert med högt pH. För vattenprover av stora volymer (DEUF) elueras patronen i laboratoriet och eluatet koncentreras med polyetylenglykol (PEG)-fällning. Avloppsvattenprovet koncentreras vid behov antingen med PEG-fällning eller med hjälp av metoden för tvåfasseparation. RNA isoleras från koncentratet och den för rotavirus specifika delen av RNA kopieras genom PCR med omvänd transkription (RT-PCR) genom s.k. Real Time -PCR-analys.

Metoden är inte ackrediterad.

Sapovirus isoleras från hushålls- och naturvattenprover genom att vattenprovet filtreras genom ett filter med positiv laddning.

Vid behov görs en förfiltrering av provet. Från filtret elueras virusen i en buffert med högt pH. För vattenprover av stora volymer (DEUF) elueras patronen i laboratoriet och eluatet koncentreras med polyetylenglykol (PEG)-fällning. Avloppsvattenprovet koncentreras vid behov antingen med PEG-fällning eller med hjälp av metoden för tvåfasseparation. RNA isoleras från koncentratet och den för sapovirus specifika delen av RNA kopieras genom PCR med omvänd transkription (RT-PCR) genom s.k. Real Time -PCR-analys.

Metoden är inte ackrediterad.

För att identifiera bakteriestammar kan man bland annat använda biokemiska sockerserier, såsom API-tester (Biomerieux), polymeraskedjereaktioner (PCR), Maldi-TOF-metoden samt 16S rRNA:s sekvensering.

Artbestämningen är inte ackrediterad.

Legionellabakterier undersöks i vattenprover samt i fastare provmaterial, såsom slam, mylla eller kompost. Bestämningen kan också göras med svepprov.

Från proverna fastställs legionellabakterier med odlingsmetod enligt standarden SFS-EN ISO 11731:2017 (Water quality. Enumeration of Legionella).

Vattenprov av renaste kvalitet (Matris A) analyseras med standardmetoden så att provet koncentreras. Lite smutsigare vatten, såsom kylvatten och processvatten, analyseras enligt faserna i standarden Matris B, som utöver koncentration även omfattar utspädning. De smutsigaste proverna, såsom avloppsvatten, slam och jordiga prover, analyseras enligt standarden Matris C och delvis Matris B, som omfattar utspädning före andra behandlingar. Svepproverna analyseras enligt bilagan till standarden (Annex I).

Legionellafynd typindelas med fällningstester som arten Legionella pneumophila, serogrupp 1 eller 2–14, eller andra arter av Legionella. I metoden används antibiotika, syratvätt och värmebehandling för att förhindra förökningen av andra mikrober. Legionellakolonier börjar i allmänhet bli synliga i kärlen efter 4–5 dygn, och odlingen fortsätter fram till 10–12 dygn.

Metoden är ackrediterad inom kompetensområdena hushållsvatten och varmt bruksvatten.

I legionellaanalyserna enligt matriserna A-C ingår i samma pris också bestämning av heterotrofiska bakterier genom odling (R2A-medium, 20 °C, 14 dygn), eftersom det ger bakgrundsinformation om de allmänna växtförhållanden som vattensystemet erbjuder mikrober.

För prov från kylsystem (Matris B) görs också bestämning av aerobiska mikrober genom odling (TH-medium, 30 °C, 2 dygn). Närmare beskrivningar av dessa definitioner finns under punkten nedan: "Mikrobiologiska analyser som kompletterar analysen av legionellabakterier".

Aerobiska mikrober (under 100 ml)
De aerobiska mikroberna fastställs i vattenprover som ytodling på TH-medium under en odlingstid på 2 dygn.

I de europeiska tekniska legionella anvisningarna presenteras antalet aerobiska mikrober >10⁷ pmy/l som åtgärdsgräns för tilläggsundersökning och rengöring av kylvattensystem och antalet >10⁸ pmy/l som gräns för snabba rengöringsåtgärder. Metoden används parallellt med legionellaanalyser av kylvattenprover. 

Metoden är inte ackrediterad.

European Technical Guidelines for the Prevention, Control and Investigation of Infections Caused by Legionella species, June 2017

Heterotrofa bakterier (under 100 ml)
Heterotrofa bakterier bestäms i vattenprover på R2A-medium under en odlingstid på 14 dygn. Metoden används parallellt med legionellaanalyser för att utreda vattensystemets allmänna bakteriologiska status. 

Metoden är inte ackrediterad.

Termofila campylobacter fastställs i hushållsvatten, naturliga vattendrag och avloppsvatten enligt standarden ISO 17995:2019 (Water quality - Detection and enumeration of thermotolerant Campylobacter spp.). Proverna filtreras vid behov på membran som överförs till anrikningsbuljongen innan de överförs till det fasta odlingsmediet. Den undersökta volymen/provet är i allmänhet 4 liter.

Metoden är ackrediterad inom kompetensområdet hushållsvatten.

Konstaterandet av salmonella i hushållsvatten, naturliga vattendrag och avloppsvatten grundar sig på standarden ISO 19250:2010 (Water quality - Detection of Salmonella spp.). I metoden filtreras proverna på membran som överförs till anrikningsbuljongen innan de överförs till det fasta odlingsmediet.

Metoden är inte ackrediterad.

Konstaterandet av bakterier av släktet Vibrio i ytvattenprover grundar sig på membranfiltrerings- och ytspridningsmetoder på TCBS-medium enligt standarden ISO 21872-1:2017 (Microbiology of the food chain - Horizontal method for the determination of Vibrio spp. - Part 1: Detection of potentially enteropathogenic Vibrio parahaemolyticus, Vibrio cholerae and Vibrio vulnificus) samt på ChromAgar-Vibrio-medium. Artbestämningen görs antingen med MALDI-TOF-metoden eller med artspecifika PCR-metoder.

Metoden är inte ackrediterad.

Protozoer bestäms med hjälp av en genpåvisningsmetod i vattenproverna, varvid en vattenprovpatron som koncentrerats med provtagningsmetoden för stora volymer (DEUF) elueras i ett laboratorium och eluatet koncentreras till membranfiltret.

Från membranfiltret isoleras nukleinsyror (DNA och RNA) från vattenprovet. Nukleinsyrorna analyseras med en kvantitativ (RT-)qPCR-metod som grundar sig på påvisning och kvantifiering av en specifik gen för mikroben som undersöks med hjälp av standarslinje.

Metoden är inte ackrediterad.

Clostridium perfringens -bakterien analyseras i hushållsvatten, naturliga vattendrag och avloppsvatten enligt standarden SFS-EN ISO 14189:2016 (Veden laatu. Clostridium perfringensin pesäkemäärän määrittäminen. Kalvosuodatusmenetelmä) anaerobt på TSC-medium.

Test för vegetativa celler utförs på provet utan behandling och för testning av sporer används värmebehandling. C. perfringens -kolonier säkerställs med hjälp av ett surt fosfatastest. TSC-mediet kan också användas för bestämning av clostridium-sporer som reducerar sulfit enligt SFS-EN 26461-2:2013 (Veden laatu. Sulfiittia pelkistävien anaerobien (klostridit) itiöiden osoitus ja lukumäärän määritys. Del 2. Kalvosuodatusmenetelmä).

Metoden är inte ackrediterad.

F-specifika kolifager bestäms för hushållsvatten, ytvatten och avloppsvatten enligt den internationella metoden US EPA Method 1601:2001 (Male-specific (F+) and Somatic Coliphage in Water by Two-step Enrichment Procedure) och US EPA Method 1602:2001 (Male-specific (F+) and Somatic Coliphage in Water by Single Agar Layer (SAL) Procedure) genom kvantitativ plackteknik eller kvalitativt med anrikningsmetoden.

Metoderna är inte ackrediterade.

Det heterotrofiskt koloniantalet fastställs i vattenprover genom ytodling på R2A-medium med en odlingstid på 7 dygn. På R2A-medium erhålls tack vare den mer gynnsamma näringssammansättningen för mikrober i hushållsvatten och den långa inkuberingstiden större koloniantal än då fastställandet utförs i enlighet med standarden SFS-EN ISO 6222. (Veden laatu. Viljeltävien mikro-organismien lukumäärän laskeminen. Pesäkelasku siirrostamalla agar-ravintoalustaan).

Metoden är ackrediterad inom kompetensområdet hushållsvatten.

Det heterotrofiskt koloniantalet fastställs i enlighet med standarden SFS-EN ISO 6222 (Veden laatu. Viljeltävien mikro-organismien lukumäärän laskeminen. Pesäkelasku siirrostamalla agar-ravintoalustaan) genom ingjutning i TH-medier.

Metoden är ackrediterad inom kompetensområdet hushållsvatten.

Koliforma bakterier och Escherichia coli -bakterien fastställs i hushållsvatten, naturliga vattendrag och avloppsvatten enligt standarden SFS 3016:2011 (Veden laatu. Koliformisten bakteerien kokonaismäärän määritys kalvosuodatusmenetelmällä) och enligt standarden SFS-EN ISO 9308-1:2014/A1:2017 (Veden laatu. Escherichia coli -bakteerin ja koliformisten bakteerien lukumäärän määritys. Del 1: Kalvosuodatusmenetelmä vesille, joissa on vähän taustabakteeristoa) med Les Endo-medium och det kromogena odlingsmediet Chromocult. Vanligen filtreras 100 ml och 1 000 ml prov på båda medierna.

Metoden är ackrediterad inom kompetensområdet hushållsvatten.

Somatiska kolifager fastställs kvantitativt med placktekniken från hushållsvatten och råvatten som används vid framställning av hushållsvatten enligt standarderna SFS-EN ISO 10705-2:2000 (Veden laatu. Bakteriofaagien havaitseminen ja laskeminen. Del 2: Somaattisten kolifaagien laskeminen) och ISO 10705-3:2003 (Water quality – Detection and enumeration of bacteriophages – Part 3: Validation of methods for concentration of bacteriophages from water). Vanligen filtreras 100 ml prov.

Metoden är ackrediterad inom kompetensområdet råvatten.

Intestinala enterokocker fastställs i hushållsvatten, naturliga vattendrag och avloppsvatten i enlighet med standarden SFS-EN ISO 7899-2:2000 (Veden laatu. Suolistoperäisten enterokokkien laskeminen. Del 2: Kalvosuodatusmenetelmä). Vanligen filtreras 100 ml och 1000 ml prov.

Metoden är ackrediterad inom kompetensområdet hushållsvatten.

Med det urval av metoder som används för att spåra ursprunget av intestinala mikrober är det möjligt att upptäcka förekomsten av intestinal förorening i ett vattenprov och spåra huruvida vattenprovet innehåller intestinala bakterier från människa, idisslande nötboskap, fjäderfä, svin eller mås. Dessutom är det möjligt att utreda förekomsten av intestinala bakterier hos hästar, får, hundar och fåglar i det vattenprov som undersöks.

Den provvolym som behövs är minst 2 liter, eller så kan provet tas med provtagning av stora vattenvolymer (DEUF).

Nukleinsyror (DNA och RNA) isoleras från vattenproverna. Analysen görs genom PCR med omvänd transkription (RT-PCR) med s.k. Real Time -PCR-analys, som bygger på att den undersökta genens DNA eller det ribosomala RNA-värdet och bakteriecellen påvisas och kvantifieras med hjälp av en standarskurva. I metabolt aktiva bakterier förekommer det fler kopior av ribosomalt RNA än motsvarande DNA-genkopior. Testobjekten och provvolymen väljs enligt kundens begäran ur ett urval av allmänna och värdspecifika (RT-)qPCR-metoder.

I analysutbudet ingår markörer för allmänna intestinala föroreningar (GenBac3) och specifika föroreningar av människor (HF183), idisslare (Rum-2-Bac), fjäderfä (CL) och svin (Pig-2-Bac). I utbudet ingår dessutom markörer för allmänna intestinala föroreningar av fåglar (GFD), måsar (Gull4), hästar (HorsemtDNA), får (SheepmtDNA) och hundar för specifik förorening (DogmtDNA).

Metoden är inte ackrediterad.

Mängden aktinomyceter fastställs i vattenprover med membranfiltrering med stärkelse-kaseinmedier. De filtrerade provmängderna är i intervallet 1–200 ml. Skålarna avläsas efter 7 dygns och 14 dygns inkubation. 

Metoden är inte ackrediterad

Mängden jäst och mögel fastställs i vattenproverna med membranfiltrering med 2 % maltextrakt (M2)-medier. De filtrerade provmängderna är i intervallet 1–200 ml.

Metoden är inte ackrediterad.

Med AOC avses mängden organiskt kol i provvattnet som är direkt tillgänglig för mikroberna som källa till energi och kol i cellerna.

I AOC-analysen tillsätts två renstrukna bakterieodlingar i parallella prov: Pseudomonas fluorescens P17 och Aquaspirillum sp. NOX, vilkas förökning följs upp genom odling på R2A-agar. Mängden AOC fastställs utifrån den maximala kolonimängden för bakterier som vattnet i proverna åstadkommer.

Mängden kol som är tillgänglig för mikroberna beräknas med två kalkylmetoder:

• AOC-resultatet beräknas på så sätt att förökningen av både Pseudomonas P17- och Aquaspirillum NOX -bakterierna standardiseras genom att endast använda natriumacetat som modellmedium.
• AOC-resultaten beräknas också på så sätt att förökningen av Pseudomonas P17-bakterierna standardiseras genom att använda natriumacetat som modellmedium och förökningen av Aquaspirillum NOX har dessutom standardiserats med natriumoxalat. Den slutliga koncentrationen av AOC meddelas i detta fall som koncentrationen av organiskt material som motsvarar både acetat- och oxalatkol.

Metoden är inte ackrediterad.

Med MAP (microbially available phosphorus) avses oorganisk och organisk fosfor i vattenprovet som en testorganism kan uppta från vattnet för att bilda celler och upprätthålla sin metaboli.

I MAP-analysen tillsätts två renstrukna bakterieodlingar i parallella prov, Pseudomonas fluorescens P17, vars förökning följs upp genom odling på R2A-agar. Testförhållandena ställs in med hjälp av oorganiska och organiska (acetat) näringslösningar på så sätt att endast koncentrationen av fosfor begränsar testorganismens förökning. Mängden MAP fastställs utifrån den maximala kolonimängden för bakterier som vattnet i proverna åstadkommer. Analysens mätkänslighet är 80 ng PO4-P/l.

MAP-resultatet beräknas på så sätt att förökningen av bakterien Pseudomonas P17 standardiseras med dinatrium-vätefosfat (Na2HPO4) som medium (0–10 μg PO4-P/l ). De slutliga resultatet meddelas som koncentrationen av fosfor som motsvarar fosfatfosfor.

Metoden är inte ackrediterad.