CPE-esiintyvyys Suomessa

Kuvaajassa näkyy CPE-kantojen määrä pylväinä ja lajijakauma vuosina 2013–2022. Vuodesta 2014 kantojen määrissä oli tasaista nousua vuoteen 2018 asti, sen jälkeen vuodet 2018-2021 oli laskusuuntaiset. Vuonna 2022 kantoja löytyi yli kaksin kertaisesti edelliseen vuoteen verrattuna. E. coli ja K. pneumoniae ovat olleet yleisimmät lajit. C. freundii lajin löydökset on olleet kasvussa vuodesta 2015 asti.

CPE-kantojen määrä ja lajijakauma vuosina 2013–2022.

Vuonna 2022 tartuntatautirekisteriin ilmoitettiin 69 löydöstä, joissa enterobakteeri oli resistentti karbapeneemille eli bakteerikanta oli mahdollisesti CPE (Carbapenemase-producing Enterobacterales). Löydöksistä 33 oli Esherichia colia, 31 Klebsiella pneumoniaeta ja 5 Enterobacter cloacaeta

THL:ään lähetetään ilmoitettavien lajien lisäksi myös muita bakteerilajeja, joilla on tai epäillään olevan karbapenemaasigeeni. THL:ään lähetettiin vuonna 2022 yhteensä 177 CPE-epäilyä, joista 117 varmistui karbapenemaasia tuottaviksi. Tämä on yli kaksinkertainen määrä edellisvuoteen verrattuna (2021: 50). 

Eniten oli K. pneumoniae - (39) ja E. coli -kantoja (38). E. cloacae -kantoja oli yksi. Tartuntatautirekisteriin ilmoitettavien enterobakteereiden lisäksi muita Enterobacterales-lahkon lajeja oli 39, joista C. freundii kantoja oli 31. 

Yleisimmät karbapenemaasit olivat KPC-2, NDM-1 ja OXA-48.Viime vuosina havaittu KPC-geenin osuuden kasvu selittyy suurelta osin havaituilla rypäillä, joissa karbapenemaasigeeninä on ollut KPC-2. K. pneumoniae -kantojen osalta yleisimmät sekvenssityypit (ST) olivat ST147 ja ST307 ja E. coli -kantojen osalta ST38 ja ST405. 

Suuri osa (57/117) CPE-kannoista löytyi seulontanäytteistä, veriviljelylöydöksiä oli viime vuonna vain kolme. 

Potilaista noin puolet oli 60 vuotta täyttäneitä (vaihteluväli, 0–98). 

Vuosina 2017–2022 keskimäärin kolmannekseen vuosittaisista CPE-löydöksistä liittyi mahdollista paikallista leviämistä eli niille löytyi geneettisesti läheinen kanta. Kaikkien kohdalla ei kuitenkaan löydetty epidemiologista linkkiä. 

Laajimmat havaitut rypäät vuonna 2022 olivat C. freundii ST18 ja ST8 kantojen aiheuttamia, molemmissa karbapenemaasigeeninä oli KPC-2.  

Vuosina 2018–2022 yleisin CPE-löydös oli E. coli (noin 39 %). Tartuntatautirekisteriin ilmoitettavat lajilöydökset (K. pneumoniae, E. coli ja E. cloacae) kattoivat 77 % kaikista CPE-löydöksistä viimeisten viiden vuoden aikana. 

CPE-tapausten määrä on Suomessa edelleen melko pieni. Vuosien 2019–2021 aikana CPE-kantojen määrä hiukan väheni, mutta 2022 nähtiin merkittävä kasvu.

Kuvaajassa näkyy karbapenemaasigeenien jakauma Suomessa havaituilla CPE-kannoilla vuosina 2013–2022 eli NDM, KPC, OXA-48-like, VIM ja muiden geenien osuudet. OXA-48-like löydökset on lisääntyneet vuosista 2013 ja 2014 suhteessa enemmän kuin kahden muun yleisemmän (NDM ja KPC) löydökset.

Karbapenemaasigeenien jakauma Suomessa havaituilla CPE-kannoilla vuosina 2013–2022.

CPE:n aiheuttamat rypäät vuonna 2022.
Vuosi/vuodet     Tapauksia yhteensä     Tapauksia vuonna 2022     Laji     Sekvenssityyppi     Karbapenemaasi     Rypään status
2016-2022     47    20    C. freundii     ST18     KPC-2    Varmistettu
2019-2022    11    7     C. freundii     ST8     KPC-2    Varmistettu
2018-2022     2     1    C. freundii     ST22    NDM-1    Mahdollinen
2019-2022     2    1     E. coli     ST244     OXA-48     Mahdolline
2018-2022    4     1    E. coli     ST38     OXA-244     Mahdollinen
2021-2022     4     2     E. coli     ST410    KPC-2    Varmistettu
2022    2    2     E. coli     ST46     NDM-5    Varmistettu
2022    3     3    K. pneumoniae     ST147    NDM-1    Varmistettu
2022     4    4     K. pneumoniae     ST147     NDM-1     Varmistettu
2021-2022     2     1     K. pneumoniae     ST15     OXA-48    Mahdollinen
2022     2    2    K. pneumoniae    ST258    KPC-2     Mahdollinen
2017-2022    3     1    K. pneumoniae    ST307     KPC-3     Mahdollinen
2018-2022     5     1    K. pneumoniae     ST395     OXA-48     Varmistettu

 CPE:n aiheuttamat rypäät vuonna 2022. Mahdollinen ryväs on määritelty siten, että cgMLST-analyysissa on ollut vähintään kaksi geneettisesti läheistä kantaa (enintään 10 alleelin erolla). Jos geneettisesti havaitun rypään potilailla (edes kahdella) on havaittu olevan epidemiologinen linkki, tällöin se on varmistettu ryväs.