CPE-esiintyvyys Suomessa
CPE-kantojen määrä ja lajijakauma vuosina 2013–2022.
Vuonna 2022 tartuntatautirekisteriin ilmoitettiin 69 löydöstä, joissa enterobakteeri oli resistentti karbapeneemille eli bakteerikanta oli mahdollisesti CPE (Carbapenemase-producing Enterobacterales). Löydöksistä 33 oli Esherichia colia, 31 Klebsiella pneumoniaeta ja 5 Enterobacter cloacaeta.
THL:ään lähetetään ilmoitettavien lajien lisäksi myös muita bakteerilajeja, joilla on tai epäillään olevan karbapenemaasigeeni. THL:ään lähetettiin vuonna 2022 yhteensä 177 CPE-epäilyä, joista 117 varmistui karbapenemaasia tuottaviksi. Tämä on yli kaksinkertainen määrä edellisvuoteen verrattuna (2021: 50).
Eniten oli K. pneumoniae - (39) ja E. coli -kantoja (38). E. cloacae -kantoja oli yksi. Tartuntatautirekisteriin ilmoitettavien enterobakteereiden lisäksi muita Enterobacterales-lahkon lajeja oli 39, joista C. freundii kantoja oli 31.
Yleisimmät karbapenemaasit olivat KPC-2, NDM-1 ja OXA-48.Viime vuosina havaittu KPC-geenin osuuden kasvu selittyy suurelta osin havaituilla rypäillä, joissa karbapenemaasigeeninä on ollut KPC-2. K. pneumoniae -kantojen osalta yleisimmät sekvenssityypit (ST) olivat ST147 ja ST307 ja E. coli -kantojen osalta ST38 ja ST405.
Suuri osa (57/117) CPE-kannoista löytyi seulontanäytteistä, veriviljelylöydöksiä oli viime vuonna vain kolme.
Potilaista noin puolet oli 60 vuotta täyttäneitä (vaihteluväli, 0–98).
Vuosina 2017–2022 keskimäärin kolmannekseen vuosittaisista CPE-löydöksistä liittyi mahdollista paikallista leviämistä eli niille löytyi geneettisesti läheinen kanta. Kaikkien kohdalla ei kuitenkaan löydetty epidemiologista linkkiä.
Laajimmat havaitut rypäät vuonna 2022 olivat C. freundii ST18 ja ST8 kantojen aiheuttamia, molemmissa karbapenemaasigeeninä oli KPC-2.
Vuosina 2018–2022 yleisin CPE-löydös oli E. coli (noin 39 %). Tartuntatautirekisteriin ilmoitettavat lajilöydökset (K. pneumoniae, E. coli ja E. cloacae) kattoivat 77 % kaikista CPE-löydöksistä viimeisten viiden vuoden aikana.
CPE-tapausten määrä on Suomessa edelleen melko pieni. Vuosien 2019–2021 aikana CPE-kantojen määrä hiukan väheni, mutta 2022 nähtiin merkittävä kasvu.
Karbapenemaasigeenien jakauma Suomessa havaituilla CPE-kannoilla vuosina 2013–2022.
Vuosi/vuodet | Tapauksia yhteensä | Tapauksia vuonna 2022 | Laji | Sekvenssityyppi | Karbapenemaasi | Rypään status |
---|---|---|---|---|---|---|
2016-2022 | 47 | 20 | C. freundii | ST18 | KPC-2 | Varmistettu |
2019-2022 | 11 | 7 | C. freundii | ST8 | KPC-2 | Varmistettu |
2018-2022 | 2 | 1 | C. freundii | ST22 | NDM-1 | Mahdollinen |
2019-2022 | 2 | 1 | E. coli | ST244 | OXA-48 | Mahdolline |
2018-2022 | 4 | 1 | E. coli | ST38 | OXA-244 | Mahdollinen |
2021-2022 | 4 | 2 | E. coli | ST410 | KPC-2 | Varmistettu |
2022 | 2 | 2 | E. coli | ST46 | NDM-5 | Varmistettu |
2022 | 3 | 3 | K. pneumoniae | ST147 | NDM-1 | Varmistettu |
2022 | 4 | 4 | K. pneumoniae | ST147 | NDM-1 | Varmistettu |
2021-2022 | 2 | 1 | K. pneumoniae | ST15 | OXA-48 | Mahdollinen |
2022 | 2 | 2 | K. pneumoniae | ST258 | KPC-2 | Mahdollinen |
2017-2022 | 3 | 1 | K. pneumoniae | ST307 | KPC-3 | Mahdollinen |
2018-2022 | 5 | 1 | K. pneumoniae | ST395 | OXA-48 | Varmistettu |
CPE:n aiheuttamat rypäät vuonna 2022. Mahdollinen ryväs on määritelty siten, että cgMLST-analyysissa on ollut vähintään kaksi geneettisesti läheistä kantaa (enintään 10 alleelin erolla). Jos geneettisesti havaitun rypään potilailla (edes kahdella) on havaittu olevan epidemiologinen linkki, tällöin se on varmistettu ryväs.