EHECin esiintyvyys Suomessa
Vuonna 2023 tartuntatautirekisteriin ilmoitettiin 306 enterohemorragisen Escherichia coli (EHEC) -bakteerin aiheuttamaa tapausta. Ilmaantuvuus oli 5.5/100 000 asukasta kohti. Tartunnoista 63 % (163) luokiteltiin kotimaisiksi.
THL:n laboratorioon saatiin tyypitettäväksi 203 henkilön näyte, joka useimmiten oli ulostenäytteen primaarimalja. Näytteet liittyivät kotimaisiin tautitapauksiin tai alkuperää ei oltu ilmoitettu. Näytteistä 156 (77%) saatiin varmistettua STECiksi (shigatoksiinia tuottava E. coli) stx-geenit osoittavalla pcr-menetelmällä. STEC-kannasta saatiin puhdasviljelmä 127 näytteestä (81%). 29 näytteestä STEC-kantaa ei saatu eristettyä.
Eristetyt kannat jakautuivat 37:ään O-seroryhmään, joista yleisimmät olivat O26 (20 kantaa, 17%), O157 (18 kantaa, 14%), O146 (12 kantaa, 9,4%), O63 (11 kantaa, 8,7%) ja O103 (7 kantaa, 5,5%).
Stx2a oli yleisin stx-geenin alatyyppi (27 kantaa, 22%). Kannat, joilla esiintyy stx2a ainoana alatyyppinä, aiheuttavat useammin vakavamman taudin (veriripuli tai HUS). Muita yleisimpiä stx-alatyyppejä olivat matalamman taudinaiheuttamiskyvyn stx1a (24 kantaa, 19%), stx2b (18 kantaa, 15%) ja stx2f (16 kantaa, 13%).
Kokogenomin sekvensointiin perustuvalla cgMLST-menetelmällä todettiin kaksi pientä ryvästä (enemmän kuin kolme tapausta), jotka molemmat olivat elo-syyskuussa. Kuuden tapauksen ryväs koostui serotyypin O26:H11-kannoista joilla oli stx-alatyyppi 2a. Viiden tapauksen ryväs muodostui serotyypin O63:H6- ja stx-alatyypin 2f-kannoista.
Näytteistä neljä liittyi HUS-tapaukseen. HUS-tapausten STEC-kannat olivat serotyyppejä O157:H7 (2 kantaa), O26:H11 (1 kanta) ja O1:H20 (1 kanta). Kaikkien kantojen stx-alatyyppi oli 2a.
Kymmeneen STEC-tapaukseen liittyi maatilakontakti. Kahden tapauksen kontaktitilalta eristettiin potilaskantojen kanssa genotyypiltään samanlainen STEC-kanta.
